RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 THAP11Q96EK4 314 aa7.05□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 GNPATO15228 680 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.03□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 MSS51Q4VC12 460 aa7.03□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.03□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RBM39-242ENST00000498280 WNT7AO00755 349 aa7.02□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.02□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 SENP2Q9HC62 589 aa7.02□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.02□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 SMPD1P17405 629 aa7□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 TRIM47Q96LD4 638 aa7□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 GCGRP47871 477 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 TRIM32Q13049 653 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 Q3C1V9 767 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 KIFC2Q96AC6 838 aa6.99□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 BRICD5Q6PL45 260 aa6.98□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.97□□□□□ -1.29
RBM39-242ENST00000498280 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.96□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 J3QL48 77 aa6.96□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 MMP16P51512 607 aa6.95□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.95□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.95□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 GMPRP36959 345 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 HPS1Q92902 700 aa6.94□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.93□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.93□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 WNT7BP56706 349 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 HLA-CQ95604 372 aa6.92□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 VEGFBP49765 207 aa6.9□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.9□□□□□ -1.3
RBM39-242ENST00000498280 USP46P62068 366 aa6.89□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 IRF6O14896 467 aa6.88□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 KDM4AO75164 1064 aa6.88□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 CD46P15529 392 aa6.88□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 ALDH1A1P00352 501 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 MAP2K5Q13163 448 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 IRF7Q92985 503 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 SKOR1P84550 965 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 GUCA2AQ02747 115 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 ERBB4Q15303 1308 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 BMP1P13497 986 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 JUNDP17535 347 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 CCDC102AQ96A19 550 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-242ENST00000498280 H3BM21 787 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-242ENST00000498280 HOXA2O43364 376 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-242ENST00000498280 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-242ENST00000498280 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-242ENST00000498280 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RBM39-242ENST00000498280 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RBM39-242ENST00000498280 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-242ENST00000498280 RETREG3Q86VR2 466 aa6.8□□□□□ -1.32
RBM39-242ENST00000498280 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
RBM39-242ENST00000498280 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-242ENST00000498280 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RBM39-242ENST00000498280 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-242ENST00000498280 SIAH2O43255 324 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 MS4A1P11836 297 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 CLCN1P35523 988 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 SCARF1Q14162 830 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 ZFP42Q96MM3 310 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 NDUFV2P19404 249 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 GSK3AP49840 483 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 PTPRNQ16849 979 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 C6orf229H3BNL8 230 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 SH3BP2P78314 561 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 KCNMA1Q12791 1236 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 ADH1CP00326 375 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 FDX1P10109 184 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 NNTQ13423 1086 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 LINC01559Q495D7 138 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-242ENST00000498280 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.72□□□□□ -1.33
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