RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		17.03	■□□□□ 0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP152	O94986	1710 aa		17.03	■□□□□ 0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		17.03	■□□□□ 0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		17.03	■□□□□ 0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM94	Q12767	1356 aa		17.02	■□□□□ 0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	KANK1	Q14678	1352 aa		17.02	■□□□□ 0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF15	Q9NS87	1388 aa		17.02	■□□□□ 0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	POTEF	A5A3E0	1075 aa		17.02	■□□□□ 0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	17.02	■□□□□ 0.32
SKAP2-209	ENST00000497511	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		17.02	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		17.02	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	17.02	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		17.02	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNA6	P17658	529 aa		17	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		17	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	POTEA	Q6S8J7	498 aa		17	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	17	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		17	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		16.99	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	16.99	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		16.98	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	16.96	■□□□□ 0.31
SKAP2-209	ENST00000497511	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		16.96	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	MSH6	P52701	1360 aa		16.95	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	IDI1	Q13907	227 aa		16.95	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		16.95	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	16.95	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PIK3C2B	O00750	1634 aa		16.95	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRP6	P59044	892 aa		16.94	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		16.92	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	16.92	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	POTEB2	H3BUK9	544 aa		16.92	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	16.92	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	16.92	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		16.92	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCC5	O15440	1437 aa		16.92	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	SLAIN2	Q9P270	581 aa		16.91	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	16.9	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	C14orf37	Q86TY3	774 aa		16.9	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		16.89	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	JCAD	Q9P266	1359 aa		16.89	■□□□□ 0.3
SKAP2-209	ENST00000497511	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	16.89	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		16.89	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K1	Q13233	1512 aa		16.89	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	DAPK1	P53355	1430 aa		16.88	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		16.88	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		16.87	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	16.87	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		16.86	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRB3	O60242	1522 aa		16.86	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		16.85	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511		G3V3G9	751 aa		16.85	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	MFRP	Q9BY79	579 aa		16.85	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		16.85	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		16.85	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	TET3	O43151	1660 aa		16.85	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	16.84	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	16.84	■□□□□ 0.29
SKAP2-209	ENST00000497511	PHLPP1	O60346	1717 aa		16.83	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	NOS1	P29475	1434 aa		16.83	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		16.83	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	NWD1	Q149M9	1564 aa		16.82	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	16.82	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM52	Q96A61	297 aa		16.82	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		16.81	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	POTEJ	P0CG39	1038 aa		16.81	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	16.81	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		16.8	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		16.8	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ATF3	P18847	181 aa		16.8	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		16.79	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		16.79	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		16.79	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	16.78	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	16.78	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		16.78	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		16.78	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	TBX22	Q9Y458	520 aa		16.77	■□□□□ 0.28
SKAP2-209	ENST00000497511	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	16.76	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	16.76	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	16.76	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	16.76	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	16.76	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	OTUD5	Q96G74	571 aa		16.76	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	16.75	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	RXRB	P28702	533 aa		16.75	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		16.75	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFYVE9	O95405	1425 aa		16.75	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		16.75	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		16.74	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	16.74	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	LRP6	O75581	1613 aa		16.74	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	16.74	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	16.73	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		16.73	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	16.73	■□□□□ 0.27
SKAP2-209	ENST00000497511	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	16.7	■□□□□ 0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRL2	O95490	1459 aa		16.69	■□□□□ 0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	16.69	■□□□□ 0.26
SKAP2-209	ENST00000497511	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		16.69	■□□□□ 0.26

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