RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495695.1

LAMA5-212, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 780 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-212ENST00000495695 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.93■■■□□ 2.38
LAMA5-212ENST00000495695 FOXD1Q16676 465 aa29.92■■■□□ 2.38
LAMA5-212ENST00000495695 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.89■■■□□ 2.38
LAMA5-212ENST00000495695 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
LAMA5-212ENST00000495695 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
LAMA5-212ENST00000495695 PPLO60437 1756 aa29.85■■■□□ 2.37
LAMA5-212ENST00000495695 CCDC125Q86Z20 511 aa29.84■■■□□ 2.37
LAMA5-212ENST00000495695 ATRNO75882 1429 aa29.84■■■□□ 2.37
LAMA5-212ENST00000495695 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.84■■■□□ 2.37
LAMA5-212ENST00000495695 MYOM2P54296 1465 aa29.81■■■□□ 2.36
LAMA5-212ENST00000495695 FOXO3O43524 673 aa29.81■■■□□ 2.36
LAMA5-212ENST00000495695 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.79■■■□□ 2.36
LAMA5-212ENST00000495695 PXDNQ92626 1479 aa29.79■■■□□ 2.36
LAMA5-212ENST00000495695 TECPR2O15040 1411 aa29.79■■■□□ 2.36
LAMA5-212ENST00000495695 ABCC11Q96J66 1382 aa29.77■■■□□ 2.36
LAMA5-212ENST00000495695 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.77■■■□□ 2.36
LAMA5-212ENST00000495695 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.77■■■□□ 2.36
LAMA5-212ENST00000495695 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.76■■■□□ 2.35
LAMA5-212ENST00000495695 STK26Q9P289 416 aa29.75■■■□□ 2.35
LAMA5-212ENST00000495695 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
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LAMA5-212ENST00000495695 RGL3Q3MIN7 710 aa29.73■■■□□ 2.35
LAMA5-212ENST00000495695 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.73■■■□□ 2.35
LAMA5-212ENST00000495695 SIRT1Q96EB6 747 aa29.73■■■□□ 2.35
LAMA5-212ENST00000495695 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.71■■■□□ 2.35
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LAMA5-212ENST00000495695 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.68■■■□□ 2.34
LAMA5-212ENST00000495695 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.68■■■□□ 2.34
LAMA5-212ENST00000495695 NUTM2FA1L443 756 aa29.67■■■□□ 2.34
LAMA5-212ENST00000495695 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.67■■■□□ 2.34
LAMA5-212ENST00000495695 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.67■■■□□ 2.34
LAMA5-212ENST00000495695 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.66■■■□□ 2.34
LAMA5-212ENST00000495695 EP400Q96L91 3159 aa29.64■■■□□ 2.34
LAMA5-212ENST00000495695 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.64■■■□□ 2.34
LAMA5-212ENST00000495695 PIK3C2GO75747 1445 aa29.63■■■□□ 2.33
LAMA5-212ENST00000495695 PSME1Q06323 249 aa29.63■■■□□ 2.33
LAMA5-212ENST00000495695 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
LAMA5-212ENST00000495695 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.62■■■□□ 2.33
LAMA5-212ENST00000495695 KIF1AQ12756 1690 aa29.62■■■□□ 2.33
LAMA5-212ENST00000495695 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
LAMA5-212ENST00000495695 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.61■■■□□ 2.33
LAMA5-212ENST00000495695 SLIT2O94813 1529 aa29.61■■■□□ 2.33
LAMA5-212ENST00000495695 IFT172Q9UG01 1749 aa29.6■■■□□ 2.33
LAMA5-212ENST00000495695 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
LAMA5-212ENST00000495695 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.59■■■□□ 2.33
LAMA5-212ENST00000495695 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.57■■■□□ 2.32
LAMA5-212ENST00000495695 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.56■■■□□ 2.32
LAMA5-212ENST00000495695 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
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LAMA5-212ENST00000495695 SBNO1A3KN83 1393 aa29.52■■■□□ 2.32
LAMA5-212ENST00000495695 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.52■■■□□ 2.32
LAMA5-212ENST00000495695 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
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LAMA5-212ENST00000495695 ARHGEF10O15013 1369 aa29.5■■■□□ 2.31
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LAMA5-212ENST00000495695 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.48■■■□□ 2.31
LAMA5-212ENST00000495695 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.47■■■□□ 2.31
LAMA5-212ENST00000495695 PRAM1Q96QH2 718 aa29.45■■■□□ 2.31
LAMA5-212ENST00000495695 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.44■■■□□ 2.3
LAMA5-212ENST00000495695 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.43■■■□□ 2.3
LAMA5-212ENST00000495695 POGKQ9P215 609 aa29.43■■■□□ 2.3
LAMA5-212ENST00000495695 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
LAMA5-212ENST00000495695 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.43■■■□□ 2.3
LAMA5-212ENST00000495695 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.42■■■□□ 2.3
LAMA5-212ENST00000495695 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.41■■■□□ 2.3
LAMA5-212ENST00000495695 DLC1Q96QB1 1528 aa29.4■■■□□ 2.3
LAMA5-212ENST00000495695 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
LAMA5-212ENST00000495695 FAM83GA6ND36 823 aa29.39■■■□□ 2.3
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LAMA5-212ENST00000495695 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
LAMA5-212ENST00000495695 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.36■■■□□ 2.29
LAMA5-212ENST00000495695 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.35■■■□□ 2.29
LAMA5-212ENST00000495695 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.35■■■□□ 2.29
LAMA5-212ENST00000495695 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.34■■■□□ 2.29
LAMA5-212ENST00000495695 STAC3Q96MF2 364 aa29.33■■■□□ 2.29
LAMA5-212ENST00000495695 PLEKHG5O94827 1062 aa29.32■■■□□ 2.28
LAMA5-212ENST00000495695 ADGRB2O60241 1585 aa29.31■■■□□ 2.28
LAMA5-212ENST00000495695 BAG6P46379 1132 aa29.3■■■□□ 2.28
LAMA5-212ENST00000495695 ABCA3Q99758 1704 aa29.29■■■□□ 2.28
LAMA5-212ENST00000495695 BTG4Q9NY30 223 aa29.29■■■□□ 2.28
LAMA5-212ENST00000495695 A0A0G2JS52 829 aa29.28■■■□□ 2.28
LAMA5-212ENST00000495695 MYT1Q01538 1121 aa29.28■■■□□ 2.28
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LAMA5-212ENST00000495695 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
LAMA5-212ENST00000495695 ADGRB1O14514 1584 aa29.26■■■□□ 2.27
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LAMA5-212ENST00000495695 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
LAMA5-212ENST00000495695 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
LAMA5-212ENST00000495695 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
LAMA5-212ENST00000495695 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
LAMA5-212ENST00000495695 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
LAMA5-212ENST00000495695 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.21■■■□□ 2.27
LAMA5-212ENST00000495695 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.2■■■□□ 2.27
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