RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494815.1

TSPAN4-212, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,187 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-212ENST00000494815 POGKQ9P215 609 aa24.96■■□□□ 1.59
TSPAN4-212ENST00000494815 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.93■■□□□ 1.58
TSPAN4-212ENST00000494815 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.93■■□□□ 1.58
TSPAN4-212ENST00000494815 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
TSPAN4-212ENST00000494815 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
TSPAN4-212ENST00000494815 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.93■■□□□ 1.58
TSPAN4-212ENST00000494815 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.92■■□□□ 1.58
TSPAN4-212ENST00000494815 SLIT1O75093 1534 aa24.92■■□□□ 1.58
TSPAN4-212ENST00000494815 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.91■■□□□ 1.58
TSPAN4-212ENST00000494815 METP08581 1390 aa24.91■■□□□ 1.58
TSPAN4-212ENST00000494815 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.9■■□□□ 1.58
TSPAN4-212ENST00000494815 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.9■■□□□ 1.58
TSPAN4-212ENST00000494815 TECPR2O15040 1411 aa24.89■■□□□ 1.58
TSPAN4-212ENST00000494815 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.88■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 SIRT1Q96EB6 747 aa24.88■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.87■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 CABP2Q9NPB3 220 aa24.87■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 EID1Q9Y6B2 187 aa24.87■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.87■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 PPP2R1AP30153 589 aa24.87■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 USP32Q8NFA0 1604 aa24.86■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.86■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.86■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 LTKP29376 864 aa24.86■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 INSRP06213 1382 aa24.86■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.86■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.85■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 CPS1P31327 1500 aa24.84■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.83■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 MED14O60244 1454 aa24.83■■□□□ 1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.81■■□□□ 1.56
TSPAN4-212ENST00000494815 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.81■■□□□ 1.56
TSPAN4-212ENST00000494815 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
TSPAN4-212ENST00000494815 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.8■■□□□ 1.56
TSPAN4-212ENST00000494815 CDK19Q9BWU1 502 aa24.8■■□□□ 1.56
TSPAN4-212ENST00000494815 NSD2O96028 1365 aa24.79■■□□□ 1.56
TSPAN4-212ENST00000494815 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.76■■□□□ 1.55
TSPAN4-212ENST00000494815 DIP2AQ14689 1571 aa24.76■■□□□ 1.55
TSPAN4-212ENST00000494815 A0A1W2PP64 1363 aa24.75■■□□□ 1.55
TSPAN4-212ENST00000494815 TBX22Q9Y458 520 aa24.74■■□□□ 1.55
TSPAN4-212ENST00000494815 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TSPAN4-212ENST00000494815 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TSPAN4-212ENST00000494815 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.72■■□□□ 1.55
TSPAN4-212ENST00000494815 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
TSPAN4-212ENST00000494815 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.72■■□□□ 1.55
TSPAN4-212ENST00000494815 MORC1Q86VD1 984 aa24.71■■□□□ 1.55
TSPAN4-212ENST00000494815 ATP7BP35670 1465 aa24.7■■□□□ 1.54
TSPAN4-212ENST00000494815 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.7■■□□□ 1.54
TSPAN4-212ENST00000494815 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TSPAN4-212ENST00000494815 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TSPAN4-212ENST00000494815 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
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TSPAN4-212ENST00000494815 ADGRB2O60241 1585 aa24.68■■□□□ 1.54
TSPAN4-212ENST00000494815 CABP1Q9NZU7 370 aa24.67■■□□□ 1.54
TSPAN4-212ENST00000494815 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
TSPAN4-212ENST00000494815 PTCH1Q13635 1447 aa24.66■■□□□ 1.54
TSPAN4-212ENST00000494815 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
TSPAN4-212ENST00000494815 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.64■■□□□ 1.54
TSPAN4-212ENST00000494815 PIK3R4Q99570 1358 aa24.64■■□□□ 1.54
TSPAN4-212ENST00000494815 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.63■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.61■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 MSH5O43196 834 aa24.61■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.61■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.6■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 NUDCQ9Y266 331 aa24.6■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.59■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 PDE3BQ13370 1112 aa24.59■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 FYB1O15117 783 aa24.58■■□□□ 1.53
TSPAN4-212ENST00000494815 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.57■■□□□ 1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.55■■□□□ 1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.54■■□□□ 1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.54■■□□□ 1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 MTHFSP49914 203 aa24.54■■□□□ 1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 CFAP53Q96M91 514 aa24.54■■□□□ 1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.53■■□□□ 1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.53■■□□□ 1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.51■■□□□ 1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 SHPRHQ149N8 1683 aa24.5■■□□□ 1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.5■■□□□ 1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.5■■□□□ 1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 AKAP12Q02952 1782 aa24.48■■□□□ 1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 KCNA6P17658 529 aa24.48■■□□□ 1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 ITSN1Q15811 1721 aa24.48■■□□□ 1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.47■■□□□ 1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 NGEFQ8N5V2 710 aa24.47■■□□□ 1.51
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