RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491530.5

CHTF18-211, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 819 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-211ENST00000491530 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CHTF18-211ENST00000491530 SHPRHQ149N8 1683 aa22.25■■□□□ 1.15
CHTF18-211ENST00000491530 STAC3Q96MF2 364 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-211ENST00000491530 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.23■■□□□ 1.15
CHTF18-211ENST00000491530 LAMC1P11047 1609 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-211ENST00000491530 MST1RQ04912 1400 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-211ENST00000491530 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-211ENST00000491530 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.19■■□□□ 1.14
CHTF18-211ENST00000491530 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-211ENST00000491530 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-211ENST00000491530 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.17■■□□□ 1.14
CHTF18-211ENST00000491530 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-211ENST00000491530 TECPR2O15040 1411 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-211ENST00000491530 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-211ENST00000491530 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-211ENST00000491530 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.14■■□□□ 1.14
CHTF18-211ENST00000491530 ADGRB1O14514 1584 aa22.14■■□□□ 1.13
CHTF18-211ENST00000491530 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CHTF18-211ENST00000491530 RXRBP28702 533 aa22.13■■□□□ 1.13
CHTF18-211ENST00000491530 AFF2P51816 1311 aa22.12■■□□□ 1.13
CHTF18-211ENST00000491530 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.09■■□□□ 1.13
CHTF18-211ENST00000491530 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.09■■□□□ 1.13
CHTF18-211ENST00000491530 C8orf37Q96NL8 207 aa22.09■■□□□ 1.13
CHTF18-211ENST00000491530 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.09■■□□□ 1.13
CHTF18-211ENST00000491530 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.08■■□□□ 1.13
CHTF18-211ENST00000491530 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.08■■□□□ 1.12
CHTF18-211ENST00000491530 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-211ENST00000491530 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-211ENST00000491530 ORAI2Q96SN7 254 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-211ENST00000491530 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-211ENST00000491530 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-211ENST00000491530 ADAMTS2O95450 1211 aa22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-211ENST00000491530 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-211ENST00000491530 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 ABCC11Q96J66 1382 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 NGLY1Q96IV0 654 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 DLC1Q96QB1 1528 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 ADGRB2O60241 1585 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 STK26Q9P289 416 aa21.99■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 RGS12O14924 1447 aa21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 KIF1AQ12756 1690 aa21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.96■■□□□ 1.11
CHTF18-211ENST00000491530 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.95■■□□□ 1.1
CHTF18-211ENST00000491530 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.95■■□□□ 1.1
CHTF18-211ENST00000491530 NUTM2FA1L443 756 aa21.93■■□□□ 1.1
CHTF18-211ENST00000491530 USP32Q8NFA0 1604 aa21.93■■□□□ 1.1
CHTF18-211ENST00000491530 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.92■■□□□ 1.1
CHTF18-211ENST00000491530 SIRT1Q96EB6 747 aa21.92■■□□□ 1.1
CHTF18-211ENST00000491530 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.92■■□□□ 1.1
CHTF18-211ENST00000491530 PXDNQ92626 1479 aa21.91■■□□□ 1.1
CHTF18-211ENST00000491530 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CHTF18-211ENST00000491530 USP21Q9UK80 565 aa21.91■■□□□ 1.1
CHTF18-211ENST00000491530 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CHTF18-211ENST00000491530 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.9■■□□□ 1.1
CHTF18-211ENST00000491530 PRAM1Q96QH2 718 aa21.89■■□□□ 1.09
CHTF18-211ENST00000491530 FOXO3O43524 673 aa21.88■■□□□ 1.09
CHTF18-211ENST00000491530 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.88■■□□□ 1.09
CHTF18-211ENST00000491530 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CHTF18-211ENST00000491530 ABCA3Q99758 1704 aa21.86■■□□□ 1.09
CHTF18-211ENST00000491530 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CHTF18-211ENST00000491530 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CHTF18-211ENST00000491530 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
CHTF18-211ENST00000491530 POGKQ9P215 609 aa21.83■■□□□ 1.09
CHTF18-211ENST00000491530 USP47Q96K76 1375 aa21.83■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 ATRNO75882 1429 aa21.81■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.81■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 ITSN1Q15811 1721 aa21.8■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.79■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.77■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.77■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.77■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CHTF18-211ENST00000491530 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.77■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.76■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.75■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 PLEKHG5O94827 1062 aa21.75■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 ALS2Q96Q42 1657 aa21.75■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.75■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.74■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 TESK2Q96S53 571 aa21.74■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.71■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 ATP7BP35670 1465 aa21.71■■□□□ 1.07
CHTF18-211ENST00000491530 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.3 ms