RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 SHPRHQ149N8 1683 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-211ENST00000488243 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-211ENST00000488243 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NISCH-211ENST00000488243 PIK3R4Q99570 1358 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-211ENST00000488243 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-211ENST00000488243 BRINP3Q76B58 766 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-211ENST00000488243 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.55■□□□□ 0.24
NISCH-211ENST00000488243 AFF2P51816 1311 aa16.54■□□□□ 0.24
NISCH-211ENST00000488243 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.53■□□□□ 0.24
NISCH-211ENST00000488243 PTPRUQ92729 1446 aa16.53■□□□□ 0.24
NISCH-211ENST00000488243 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.52■□□□□ 0.24
NISCH-211ENST00000488243 SLC24A1O60721 1099 aa16.52■□□□□ 0.24
NISCH-211ENST00000488243 RGS12O14924 1447 aa16.51■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 ADGRB1O14514 1584 aa16.51■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.5■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.5■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 SIRT1Q96EB6 747 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 ABCC11Q96J66 1382 aa16.49■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 C8orf37Q96NL8 207 aa16.48■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 TECPR2O15040 1411 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 DCCP43146 1447 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 MST1RQ04912 1400 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 DLC1Q96QB1 1528 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 METP08581 1390 aa16.46■□□□□ 0.23
NISCH-211ENST00000488243 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 USP47Q96K76 1375 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 NHSL1Q5SYE7 1610 aa16.45■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.44■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.43■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 PTCH1Q13635 1447 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.42■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTS2O95450 1211 aa16.41■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 NGLY1Q96IV0 654 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-211ENST00000488243 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-211ENST00000488243 STK26Q9P289 416 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-211ENST00000488243 NALCNQ8IZF0 1738 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-211ENST00000488243 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-211ENST00000488243 POGKQ9P215 609 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-211ENST00000488243 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
NISCH-211ENST00000488243 CDCA8Q53HL2 280 aa16.35■□□□□ 0.21
NISCH-211ENST00000488243 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
NISCH-211ENST00000488243 PRAM1Q96QH2 718 aa16.35■□□□□ 0.21
NISCH-211ENST00000488243 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.35■□□□□ 0.21
NISCH-211ENST00000488243 USP21Q9UK80 565 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-211ENST00000488243 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-211ENST00000488243 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 TMF1P82094 1093 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 TESK2Q96S53 571 aa16.33■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 ORAI2Q96SN7 254 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 EVC2Q86UK5 1308 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 CCDC125Q86Z20 511 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 EP400Q96L91 3159 aa16.3■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.29■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 ADGRB2O60241 1585 aa16.28■□□□□ 0.2
NISCH-211ENST00000488243 ATRNO75882 1429 aa16.27■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 NINLQ9Y2I6 1382 aa16.23■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 CCDC7Q96M83 1385 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 CDK19Q9BWU1 502 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-211ENST00000488243 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-211ENST00000488243 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-211ENST00000488243 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
NISCH-211ENST00000488243 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-211ENST00000488243 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-211ENST00000488243 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-211ENST00000488243 NUTM2FA1L443 756 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-211ENST00000488243 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
NISCH-211ENST00000488243 FOXO3O43524 673 aa16.18■□□□□ 0.18
NISCH-211ENST00000488243 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
NISCH-211ENST00000488243 PXDNQ92626 1479 aa16.17■□□□□ 0.18
NISCH-211ENST00000488243 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
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