RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 C8orf37Q96NL8 207 aa25.22■■□□□ 1.63
SKIV2L-211ENST00000485349 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SKIV2L-211ENST00000485349 RXRBP28702 533 aa25.21■■□□□ 1.63
SKIV2L-211ENST00000485349 STK26Q9P289 416 aa25.21■■□□□ 1.63
SKIV2L-211ENST00000485349 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SKIV2L-211ENST00000485349 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SKIV2L-211ENST00000485349 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.18■■□□□ 1.62
SKIV2L-211ENST00000485349 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.18■■□□□ 1.62
SKIV2L-211ENST00000485349 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.17■■□□□ 1.62
SKIV2L-211ENST00000485349 PXDNQ92626 1479 aa25.17■■□□□ 1.62
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.17■■□□□ 1.62
SKIV2L-211ENST00000485349 ADAMTS2O95450 1211 aa25.16■■□□□ 1.62
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCC11Q96J66 1382 aa25.16■■□□□ 1.62
SKIV2L-211ENST00000485349 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SKIV2L-211ENST00000485349 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.15■■□□□ 1.62
SKIV2L-211ENST00000485349 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.15■■□□□ 1.62
SKIV2L-211ENST00000485349 RGS12O14924 1447 aa25.14■■□□□ 1.62
SKIV2L-211ENST00000485349 MYOM2P54296 1465 aa25.14■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.13■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.12■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 NUTM2FA1L443 756 aa25.11■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 NGLY1Q96IV0 654 aa25.1■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF1AQ12756 1690 aa25.1■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SKIV2L-211ENST00000485349 FOXO3O43524 673 aa25.07■■□□□ 1.6
SKIV2L-211ENST00000485349 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SKIV2L-211ENST00000485349 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.05■■□□□ 1.6
SKIV2L-211ENST00000485349 USP21Q9UK80 565 aa25.03■■□□□ 1.6
SKIV2L-211ENST00000485349 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SKIV2L-211ENST00000485349 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 SIRT1Q96EB6 747 aa25.01■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 ATRNO75882 1429 aa25.01■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 ADGRB1O14514 1584 aa25■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 EP400Q96L91 3159 aa25■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 DLC1Q96QB1 1528 aa24.99■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 USP32Q8NFA0 1604 aa24.97■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 PRAM1Q96QH2 718 aa24.97■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 ADGRB2O60241 1585 aa24.97■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.96■■□□□ 1.59
SKIV2L-211ENST00000485349 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.95■■□□□ 1.58
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCA3Q99758 1704 aa24.94■■□□□ 1.58
SKIV2L-211ENST00000485349 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.92■■□□□ 1.58
SKIV2L-211ENST00000485349 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.92■■□□□ 1.58
SKIV2L-211ENST00000485349 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.92■■□□□ 1.58
SKIV2L-211ENST00000485349 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.9■■□□□ 1.58
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.89■■□□□ 1.58
SKIV2L-211ENST00000485349 POGKQ9P215 609 aa24.89■■□□□ 1.58
SKIV2L-211ENST00000485349 SLIT2O94813 1529 aa24.88■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.88■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.87■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.87■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.87■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 GLI3P10071 1580 aa24.87■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 SBNO1A3KN83 1393 aa24.85■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.83■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.83■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 PSME1Q06323 249 aa24.83■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.83■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.83■■□□□ 1.57
SKIV2L-211ENST00000485349 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.82■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 PLEKHG5O94827 1062 aa24.82■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.82■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.82■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 ALS2Q96Q42 1657 aa24.81■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 HRCP23327 699 aa24.81■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGEF10O15013 1369 aa24.8■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.8■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.79■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.79■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 ITSN1Q15811 1721 aa24.77■■□□□ 1.56
SKIV2L-211ENST00000485349 NRAPQ86VF7 1730 aa24.75■■□□□ 1.55
SKIV2L-211ENST00000485349 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.75■■□□□ 1.55
SKIV2L-211ENST00000485349 STAC3Q96MF2 364 aa24.75■■□□□ 1.55
SKIV2L-211ENST00000485349 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SKIV2L-211ENST00000485349 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.73■■□□□ 1.55
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP7BP35670 1465 aa24.73■■□□□ 1.55
SKIV2L-211ENST00000485349 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.71■■□□□ 1.55
SKIV2L-211ENST00000485349 VPS72Q15906 364 aa24.7■■□□□ 1.54
SKIV2L-211ENST00000485349 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SKIV2L-211ENST00000485349 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.69■■□□□ 1.54
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM83GA6ND36 823 aa24.68■■□□□ 1.54
SKIV2L-211ENST00000485349 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SKIV2L-211ENST00000485349 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms