RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482190.1

RBBP4-212, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 3

Gene RBBP4, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-212ENST00000482190 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 SLF2Q8IX21 1173 aa7.39□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.38□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 RNF40O75150 1001 aa7.38□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 EYA1Q99502 592 aa7.38□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 TSPOAP1O95153 1857 aa7.38□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 GRIN2BQ13224 1484 aa7.37□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 IRF6O14896 467 aa7.37□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 PDE4DQ08499 809 aa7.37□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 PTGDRQ13258 359 aa7.37□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.37□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 SOGA1O94964 1423 aa7.36□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.36□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 WDR97A6NE52 1622 aa7.36□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 CEP170Q5SW79 1584 aa7.36□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 CCDC102AQ96A19 550 aa7.35□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.35□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 GGCXP38435 758 aa7.34□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 AMHR2Q16671 573 aa7.34□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 PRR14Q9BWN1 585 aa7.34□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.34□□□□□ -1.23
RBBP4-212ENST00000482190 ZPR1O75312 459 aa7.33□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 COPS2P61201 443 aa7.33□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 SLC4A3P48751 1232 aa7.32□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 PRDM2Q13029 1718 aa7.32□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.31□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 WIZO95785 1651 aa7.31□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 FECHP22830 423 aa7.3□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 DNAJB2P25686 324 aa7.3□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.3□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.29□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.29□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 PTPRMP28827 1452 aa7.29□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.28□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.28□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.24
RBBP4-212ENST00000482190 RNF223E7ERA6 249 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 SHROOM2Q13796 1616 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 NUP160Q12769 1436 aa7.27□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 GRIN2AQ12879 1464 aa7.26□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 HSPA2P54652 639 aa7.26□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 IL27Q8NEV9 243 aa7.26□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 TLL1O43897 1013 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 OATP04181 439 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 CLCN1P35523 988 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 SLC19A1P41440 591 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.25□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 RCCD1A6NED2 376 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 PRR20EP86478 221 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 PRR20CP86479 221 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 PRR20DP86480 221 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 PRR20BP86481 221 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 PRR20AP86496 221 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 ZNF787Q6DD87 383 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 TEX14Q8IWB6 1497 aa7.24□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 ADCY10Q96PN6 1610 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 SPRYD7Q5W111 196 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 FAM117AQ9C073 453 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 GLI2P10070 1586 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 CFHP08603 1231 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 C14orf37Q86TY3 774 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-212ENST00000482190 DGAT1O75907 488 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 S1PR4O95977 384 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 ADH1BP00325 375 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 SLC10A3P09131 477 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 GOPCQ9HD26 462 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 PLB1Q6P1J6 1458 aa7.2□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.2□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 PBRM1Q86U86 1689 aa7.19□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.19□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 MYT1Q01538 1121 aa7.19□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 FAM161AQ3B820 660 aa7.19□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 GDF9O60383 454 aa7.18□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 NR1I2O75469 434 aa7.18□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 PKDCCQ504Y2 493 aa7.18□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.18□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 ASXL2Q76L83 1435 aa7.18□□□□□ -1.26
RBBP4-212ENST00000482190 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms