RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479589.5

NENF-204, Transcript of neudesin neurotrophic factor, humanhuman

TSL 2

Gene NENF, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENF-204ENST00000479589 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.62■■■■□ 3.13
NENF-204ENST00000479589 SHPRHQ149N8 1683 aa34.61■■■■□ 3.13
NENF-204ENST00000479589 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
NENF-204ENST00000479589 ORAI2Q96SN7 254 aa34.59■■■■□ 3.13
NENF-204ENST00000479589 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.58■■■■□ 3.13
NENF-204ENST00000479589 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
NENF-204ENST00000479589 SIRT1Q96EB6 747 aa34.55■■■■□ 3.12
NENF-204ENST00000479589 STAC3Q96MF2 364 aa34.55■■■■□ 3.12
NENF-204ENST00000479589 LRP6O75581 1613 aa34.53■■■■□ 3.12
NENF-204ENST00000479589 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
NENF-204ENST00000479589 ADGRB1O14514 1584 aa34.52■■■■□ 3.12
NENF-204ENST00000479589 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.5■■■■□ 3.11
NENF-204ENST00000479589 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
NENF-204ENST00000479589 NUTM2FA1L443 756 aa34.49■■■■□ 3.11
NENF-204ENST00000479589 PRAM1Q96QH2 718 aa34.49■■■■□ 3.11
NENF-204ENST00000479589 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.48■■■■□ 3.11
NENF-204ENST00000479589 DLC1Q96QB1 1528 aa34.48■■■■□ 3.11
NENF-204ENST00000479589 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.47■■■■□ 3.11
NENF-204ENST00000479589 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
NENF-204ENST00000479589 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
NENF-204ENST00000479589 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
NENF-204ENST00000479589 POGKQ9P215 609 aa34.46■■■■□ 3.11
NENF-204ENST00000479589 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.44■■■■□ 3.1
NENF-204ENST00000479589 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
NENF-204ENST00000479589 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.43■■■■□ 3.1
NENF-204ENST00000479589 POTEAQ6S8J7 498 aa34.41■■■■□ 3.1
NENF-204ENST00000479589 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.4■■■■□ 3.1
NENF-204ENST00000479589 FOXO3O43524 673 aa34.36■■■■□ 3.09
NENF-204ENST00000479589 PXDNQ92626 1479 aa34.33■■■■□ 3.09
NENF-204ENST00000479589 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
NENF-204ENST00000479589 KIF1AQ12756 1690 aa34.33■■■■□ 3.09
NENF-204ENST00000479589 ADGRB2O60241 1585 aa34.32■■■■□ 3.09
NENF-204ENST00000479589 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
NENF-204ENST00000479589 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
NENF-204ENST00000479589 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.3■■■■□ 3.08
NENF-204ENST00000479589 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
NENF-204ENST00000479589 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
NENF-204ENST00000479589 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.29■■■■□ 3.08
NENF-204ENST00000479589 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
NENF-204ENST00000479589 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.26■■■■□ 3.08
NENF-204ENST00000479589 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
NENF-204ENST00000479589 NEUROD1Q13562 356 aa34.25■■■■□ 3.07
NENF-204ENST00000479589 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
NENF-204ENST00000479589 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.24■■■■□ 3.07
NENF-204ENST00000479589 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.24■■■■□ 3.07
NENF-204ENST00000479589 C8orf37Q96NL8 207 aa34.24■■■■□ 3.07
NENF-204ENST00000479589 USP32Q8NFA0 1604 aa34.23■■■■□ 3.07
NENF-204ENST00000479589 ADAMTS2O95450 1211 aa34.23■■■■□ 3.07
NENF-204ENST00000479589 AFF2P51816 1311 aa34.23■■■■□ 3.07
NENF-204ENST00000479589 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.21■■■■□ 3.07
NENF-204ENST00000479589 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
NENF-204ENST00000479589 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.2■■■■□ 3.07
NENF-204ENST00000479589 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
NENF-204ENST00000479589 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.18■■■■□ 3.06
NENF-204ENST00000479589 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.16■■■■□ 3.06
NENF-204ENST00000479589 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.15■■■■□ 3.06
NENF-204ENST00000479589 NGLY1Q96IV0 654 aa34.15■■■■□ 3.06
NENF-204ENST00000479589 PSME1Q06323 249 aa34.14■■■■□ 3.06
NENF-204ENST00000479589 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.13■■■■□ 3.05
NENF-204ENST00000479589 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.1■■■■□ 3.05
NENF-204ENST00000479589 RXRBP28702 533 aa34.09■■■■□ 3.05
NENF-204ENST00000479589 SBNO1A3KN83 1393 aa34.07■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.05■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 LMOD2Q6P5Q4 547 aa34.05■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 ATP7BP35670 1465 aa34.04■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 CDK19Q9BWU1 502 aa34.04■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 ITSN1Q15811 1721 aa34.03■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.02■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 USP21Q9UK80 565 aa34.02■■■■□ 3.04
NENF-204ENST00000479589 ARHGEF10O15013 1369 aa34■■■■□ 3.03
NENF-204ENST00000479589 PLEKHG5O94827 1062 aa34■■■■□ 3.03
NENF-204ENST00000479589 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
NENF-204ENST00000479589 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
NENF-204ENST00000479589 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
NENF-204ENST00000479589 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
NENF-204ENST00000479589 QRICH2Q9H0J4 1663 aa33.97■■■■□ 3.03
NENF-204ENST00000479589 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
NENF-204ENST00000479589 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
NENF-204ENST00000479589 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.96■■■■□ 3.03
NENF-204ENST00000479589 TONSLQ96HA7 1378 aa33.95■■■■□ 3.02
NENF-204ENST00000479589 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa33.93■■■■□ 3.02
NENF-204ENST00000479589 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
NENF-204ENST00000479589 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
NENF-204ENST00000479589 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.92■■■■□ 3.02
NENF-204ENST00000479589 ABCA3Q99758 1704 aa33.92■■■■□ 3.02
NENF-204ENST00000479589 ALS2Q96Q42 1657 aa33.91■■■■□ 3.02
NENF-204ENST00000479589 CCDC61Q9Y6R9 512 aa33.91■■■■□ 3.02
NENF-204ENST00000479589 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
NENF-204ENST00000479589 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.89■■■■□ 3.02
NENF-204ENST00000479589 ATRNO75882 1429 aa33.89■■■■□ 3.02
NENF-204ENST00000479589 RGS12O14924 1447 aa33.88■■■■□ 3.01
NENF-204ENST00000479589 CABP2Q9NPB3 220 aa33.86■■■■□ 3.01
NENF-204ENST00000479589 ACEP12821 1306 aa33.85■■■■□ 3.01
NENF-204ENST00000479589 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
NENF-204ENST00000479589 SLIT2O94813 1529 aa33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms