RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445062.6

PLCXD1-208, Transcript of phosphatidylinositol specific phospholipase C X domain containing 1, human

TSL 4

Gene PLCXD1, Length 555 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLCXD1-208	ENST00000445062	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PLCXD1-208	ENST00000445062	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
PLCXD1-208	ENST00000445062	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PLCXD1-208	ENST00000445062	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PLCXD1-208	ENST00000445062	STK26	Q9P289	416 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PLCXD1-208	ENST00000445062	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PLCXD1-208	ENST00000445062	PPL	O60437	1756 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PLCXD1-208	ENST00000445062	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PLCXD1-208	ENST00000445062	FOXO3	O43524	673 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PLCXD1-208	ENST00000445062	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PLCXD1-208	ENST00000445062	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PLCXD1-208	ENST00000445062	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PLCXD1-208	ENST00000445062	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PLCXD1-208	ENST00000445062	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PLCXD1-208	ENST00000445062	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PLCXD1-208	ENST00000445062	TECPR2	O15040	1411 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PLCXD1-208	ENST00000445062	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PLCXD1-208	ENST00000445062	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PLCXD1-208	ENST00000445062	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PLCXD1-208	ENST00000445062	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PLCXD1-208	ENST00000445062	MYOM2	P54296	1465 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PLCXD1-208	ENST00000445062	PXDN	Q92626	1479 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PLCXD1-208	ENST00000445062	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
PLCXD1-208	ENST00000445062	ATRN	O75882	1429 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PLCXD1-208	ENST00000445062	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
PLCXD1-208	ENST00000445062	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32	■■■□□ 2.71
PLCXD1-208	ENST00000445062	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32	■■■□□ 2.71
PLCXD1-208	ENST00000445062	SIRT1	Q96EB6	747 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PLCXD1-208	ENST00000445062	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PLCXD1-208	ENST00000445062	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PLCXD1-208	ENST00000445062	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
PLCXD1-208	ENST00000445062	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
PLCXD1-208	ENST00000445062	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.95	■■■□□ 2.7
PLCXD1-208	ENST00000445062	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PLCXD1-208	ENST00000445062	CCDC125	Q86Z20	511 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PLCXD1-208	ENST00000445062	PSME1	Q06323	249 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PLCXD1-208	ENST00000445062	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PLCXD1-208	ENST00000445062	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
PLCXD1-208	ENST00000445062	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PLCXD1-208	ENST00000445062	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PLCXD1-208	ENST00000445062	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PLCXD1-208	ENST00000445062	IFT172	Q9UG01	1749 aa		31.89	■■■□□ 2.69
PLCXD1-208	ENST00000445062	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PLCXD1-208	ENST00000445062	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PLCXD1-208	ENST00000445062	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PLCXD1-208	ENST00000445062	KIF1A	Q12756	1690 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PLCXD1-208	ENST00000445062	PRAM1	Q96QH2	718 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PLCXD1-208	ENST00000445062	SLIT2	O94813	1529 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PLCXD1-208	ENST00000445062	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	31.82	■■■□□ 2.68
PLCXD1-208	ENST00000445062	POGK	Q9P215	609 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PLCXD1-208	ENST00000445062	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PLCXD1-208	ENST00000445062	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PLCXD1-208	ENST00000445062	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PLCXD1-208	ENST00000445062	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PLCXD1-208	ENST00000445062	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PLCXD1-208	ENST00000445062	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PLCXD1-208	ENST00000445062	PLEKHG5	O94827	1062 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PLCXD1-208	ENST00000445062	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PLCXD1-208	ENST00000445062	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PLCXD1-208	ENST00000445062	VPS72	Q15906	364 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PLCXD1-208	ENST00000445062	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
PLCXD1-208	ENST00000445062	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PLCXD1-208	ENST00000445062	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PLCXD1-208	ENST00000445062	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PLCXD1-208	ENST00000445062	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PLCXD1-208	ENST00000445062	GLI3	P10071	1580 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PLCXD1-208	ENST00000445062	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
PLCXD1-208	ENST00000445062	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PLCXD1-208	ENST00000445062	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
PLCXD1-208	ENST00000445062	DLC1	Q96QB1	1528 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PLCXD1-208	ENST00000445062	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PLCXD1-208	ENST00000445062	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
PLCXD1-208	ENST00000445062	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PLCXD1-208	ENST00000445062	FAM83G	A6ND36	823 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PLCXD1-208	ENST00000445062	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PLCXD1-208	ENST00000445062	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
PLCXD1-208	ENST00000445062	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
PLCXD1-208	ENST00000445062	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PLCXD1-208	ENST00000445062	EP400	Q96L91	3159 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PLCXD1-208	ENST00000445062	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
PLCXD1-208	ENST00000445062	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PLCXD1-208	ENST00000445062	STAC3	Q96MF2	364 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PLCXD1-208	ENST00000445062	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
PLCXD1-208	ENST00000445062	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PLCXD1-208	ENST00000445062		A0A0G2JS52	829 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PLCXD1-208	ENST00000445062	MYT1	Q01538	1121 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PLCXD1-208	ENST00000445062	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PLCXD1-208	ENST00000445062	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PLCXD1-208	ENST00000445062	ADGRB1	O14514	1584 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PLCXD1-208	ENST00000445062	ADGRB2	O60241	1585 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PLCXD1-208	ENST00000445062	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
PLCXD1-208	ENST00000445062	BTG4	Q9NY30	223 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PLCXD1-208	ENST00000445062	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
PLCXD1-208	ENST00000445062	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PLCXD1-208	ENST00000445062	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PLCXD1-208	ENST00000445062	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PLCXD1-208	ENST00000445062	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
PLCXD1-208	ENST00000445062	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.51	■■■□□ 2.63
PLCXD1-208	ENST00000445062	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PLCXD1-208	ENST00000445062	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		31.49	■■■□□ 2.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms