RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.29■■■■□ 3.56
ANKRD28-203ENST00000439830 STK26Q9P289 416 aa37.29■■■■□ 3.56
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
ANKRD28-203ENST00000439830 ABCC11Q96J66 1382 aa37.28■■■■□ 3.56
ANKRD28-203ENST00000439830 ORAI2Q96SN7 254 aa37.27■■■■□ 3.56
ANKRD28-203ENST00000439830 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.55
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM132EQ6IEE7 984 aa37.24■■■■□ 3.55
ANKRD28-203ENST00000439830 FMN2Q9NZ56 1722 aa37.24■■■■□ 3.55
ANKRD28-203ENST00000439830 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
ANKRD28-203ENST00000439830 WAPLQ7Z5K2 1190 aa37.2■■■■□ 3.55
ANKRD28-203ENST00000439830 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa37.18■■■■□ 3.54
ANKRD28-203ENST00000439830 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP37.18■■■■□ 3.54
ANKRD28-203ENST00000439830 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
ANKRD28-203ENST00000439830 AFF2P51816 1311 aa37.14■■■■□ 3.54
ANKRD28-203ENST00000439830 ESCO1Q5FWF5 840 aa37.14■■■■□ 3.54
ANKRD28-203ENST00000439830 KIF1AQ12756 1690 aa37.14■■■■□ 3.54
ANKRD28-203ENST00000439830 NPHP3Q7Z494 1330 aa37.12■■■■□ 3.53
ANKRD28-203ENST00000439830 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
ANKRD28-203ENST00000439830 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
ANKRD28-203ENST00000439830 CFAP70Q5T0N1 1121 aa37.11■■■■□ 3.53
ANKRD28-203ENST00000439830 PXDNQ92626 1479 aa37.11■■■■□ 3.53
ANKRD28-203ENST00000439830 HRCP23327 699 aa37.1■■■■□ 3.53
ANKRD28-203ENST00000439830 C8orf37Q96NL8 207 aa37.1■■■■□ 3.53
ANKRD28-203ENST00000439830 SIRT1Q96EB6 747 aa37.09■■■■□ 3.53
ANKRD28-203ENST00000439830 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
ANKRD28-203ENST00000439830 DLC1Q96QB1 1528 aa37.06■■■■□ 3.52
ANKRD28-203ENST00000439830 NUTM2FA1L443 756 aa37.06■■■■□ 3.52
ANKRD28-203ENST00000439830 RXRBP28702 533 aa37.05■■■■□ 3.52
ANKRD28-203ENST00000439830 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
ANKRD28-203ENST00000439830 ADGRB1O14514 1584 aa37.04■■■■□ 3.52
ANKRD28-203ENST00000439830 ADAMTS2O95450 1211 aa37.03■■■■□ 3.52
ANKRD28-203ENST00000439830 FOXO3O43524 673 aa37.02■■■■□ 3.52
ANKRD28-203ENST00000439830 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
ANKRD28-203ENST00000439830 NGLY1Q96IV0 654 aa36.98■■■■□ 3.51
ANKRD28-203ENST00000439830 ADGRB2O60241 1585 aa36.98■■■■□ 3.51
ANKRD28-203ENST00000439830 PRAM1Q96QH2 718 aa36.97■■■■□ 3.51
ANKRD28-203ENST00000439830 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.95■■■■□ 3.51
ANKRD28-203ENST00000439830 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.93■■■■□ 3.5
ANKRD28-203ENST00000439830 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.93■■■■□ 3.5
ANKRD28-203ENST00000439830 STAC3Q96MF2 364 aa36.92■■■■□ 3.5
ANKRD28-203ENST00000439830 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
ANKRD28-203ENST00000439830 POGKQ9P215 609 aa36.91■■■■□ 3.5
ANKRD28-203ENST00000439830 USP32Q8NFA0 1604 aa36.91■■■■□ 3.5
ANKRD28-203ENST00000439830 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
ANKRD28-203ENST00000439830 RGS12O14924 1447 aa36.88■■■■□ 3.49
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
ANKRD28-203ENST00000439830 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.86■■■■□ 3.49
ANKRD28-203ENST00000439830 USP21Q9UK80 565 aa36.86■■■■□ 3.49
ANKRD28-203ENST00000439830 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.85■■■■□ 3.49
ANKRD28-203ENST00000439830 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.85■■■■□ 3.49
ANKRD28-203ENST00000439830 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.85■■■■□ 3.49
ANKRD28-203ENST00000439830 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
ANKRD28-203ENST00000439830 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.82■■■■□ 3.48
ANKRD28-203ENST00000439830 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
ANKRD28-203ENST00000439830 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.81■■■■□ 3.48
ANKRD28-203ENST00000439830 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.81■■■■□ 3.48
ANKRD28-203ENST00000439830 ABCA3Q99758 1704 aa36.8■■■■□ 3.48
ANKRD28-203ENST00000439830 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP36.8■■■■□ 3.48
ANKRD28-203ENST00000439830 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
ANKRD28-203ENST00000439830 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
ANKRD28-203ENST00000439830 ATRNO75882 1429 aa36.78■■■■□ 3.48
ANKRD28-203ENST00000439830 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.77■■■■□ 3.48
ANKRD28-203ENST00000439830 PSME1Q06323 249 aa36.77■■■■□ 3.48
ANKRD28-203ENST00000439830 ITSN1Q15811 1721 aa36.76■■■■□ 3.47
ANKRD28-203ENST00000439830 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
ANKRD28-203ENST00000439830 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
ANKRD28-203ENST00000439830 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
ANKRD28-203ENST00000439830 SBNO1A3KN83 1393 aa36.74■■■■□ 3.47
ANKRD28-203ENST00000439830 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.74■■■■□ 3.47
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGEF10O15013 1369 aa36.69■■■■□ 3.46
ANKRD28-203ENST00000439830 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.69■■■■□ 3.46
ANKRD28-203ENST00000439830 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.69■■■■□ 3.46
ANKRD28-203ENST00000439830 ALS2Q96Q42 1657 aa36.67■■■■□ 3.46
ANKRD28-203ENST00000439830 SLIT2O94813 1529 aa36.66■■■■□ 3.46
ANKRD28-203ENST00000439830 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.66■■■■□ 3.46
ANKRD28-203ENST00000439830 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
ANKRD28-203ENST00000439830 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.65■■■■□ 3.46
ANKRD28-203ENST00000439830 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
ANKRD28-203ENST00000439830 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.62■■■■□ 3.45
ANKRD28-203ENST00000439830 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.61■■■■□ 3.45
ANKRD28-203ENST00000439830 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.6■■■■□ 3.45
ANKRD28-203ENST00000439830 ATP7BP35670 1465 aa36.6■■■■□ 3.45
ANKRD28-203ENST00000439830 CABLES1Q8TDN4 633 aa36.59■■■■□ 3.45
ANKRD28-203ENST00000439830 GLI3P10071 1580 aa36.58■■■■□ 3.45
ANKRD28-203ENST00000439830 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.58■■■■□ 3.45
ANKRD28-203ENST00000439830 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.58■■■■□ 3.45
ANKRD28-203ENST00000439830 PLEKHG5O94827 1062 aa36.57■■■■□ 3.44
ANKRD28-203ENST00000439830 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
ANKRD28-203ENST00000439830 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.56■■■■□ 3.44
ANKRD28-203ENST00000439830 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.54■■■■□ 3.44
ANKRD28-203ENST00000439830 EP400Q96L91 3159 aa36.53■■■■□ 3.44
ANKRD28-203ENST00000439830 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
ANKRD28-203ENST00000439830 BRWD3Q6RI45 1802 aa36.5■■■■□ 3.43
ANKRD28-203ENST00000439830 NRAPQ86VF7 1730 aa36.5■■■■□ 3.43
ANKRD28-203ENST00000439830 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.48■■■■□ 3.43
ANKRD28-203ENST00000439830 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
ANKRD28-203ENST00000439830 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
ANKRD28-203ENST00000439830 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.47■■■■□ 3.43
ANKRD28-203ENST00000439830 CDK19Q9BWU1 502 aa36.45■■■■□ 3.43
ANKRD28-203ENST00000439830 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms