RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439592.1

DMD-AS3-201, DMD antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene DMD-AS3, Length 293 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMD-AS3-201ENST00000439592 LIAT1Q6ZQX7 453 aa12.09□□□□□ -0.47
DMD-AS3-201ENST00000439592 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
DMD-AS3-201ENST00000439592 SLC19A1P41440 591 aa12.07□□□□□ -0.48
DMD-AS3-201ENST00000439592 MSS51Q4VC12 460 aa12.07□□□□□ -0.48
DMD-AS3-201ENST00000439592 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
DMD-AS3-201ENST00000439592 V9GY48 417 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
DMD-AS3-201ENST00000439592 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
DMD-AS3-201ENST00000439592 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa12.04□□□□□ -0.48
DMD-AS3-201ENST00000439592 C6orf229H3BNL8 230 aa12.03□□□□□ -0.48
DMD-AS3-201ENST00000439592 TPRNQ4KMQ1 711 aa12.03□□□□□ -0.48
DMD-AS3-201ENST00000439592 MMP16P51512 607 aa12.02□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 SPRYD7Q5W111 196 aa12.01□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.01□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 DXOO77932 396 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 MYSM1Q5VVJ2 828 aa12□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 RETREG3Q86VR2 466 aa12□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 SPTLC1O15269 473 aa11.99□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.99□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.99□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 FAM117AQ9C073 453 aa11.98□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.98□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 GFRA3O60609 400 aa11.97□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 CABLES1Q8TDN4 633 aa11.97□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 JUNDP17535 347 aa11.96□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.96□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 TRIM67Q6ZTA4 783 aa11.96□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
DMD-AS3-201ENST00000439592 MTMR2Q13614 643 aa11.95□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 ZNF697Q5TEC3 545 aa11.95□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.95□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.95□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 GJA5P36382 358 aa11.94□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 PRR7Q8TB68 274 aa11.94□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 HRCP23327 699 aa11.93□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 QPCTQ16769 361 aa11.93□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.93□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.92□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 CFAP99D6REC4 459 aa11.91□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 RPIAP49247 311 aa11.91□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 TNFRSF10AO00220 468 aa11.9□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
DMD-AS3-201ENST00000439592 FOXC1Q12948 553 aa11.89□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 NEUROD2Q15784 382 aa11.89□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.89□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 GDF9O60383 454 aa11.88□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.88□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.88□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.87□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 Q6ZNB5 142 aa11.87□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.87□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 LILRB3O75022 631 aa11.86□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 TRIM32Q13049 653 aa11.86□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.85□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 LCE2BO14633 110 aa11.84□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 LAPTM4AQ15012 233 aa11.84□□□□□ -0.51
DMD-AS3-201ENST00000439592 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.83□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.82□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 PTPRNQ16849 979 aa11.82□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.82□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 DESI1Q6ICB0 168 aa11.82□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 IL27Q8NEV9 243 aa11.82□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 TSC1Q92574 1164 aa11.82□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 SKOR1P84550 965 aa11.81□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 PRR20EP86478 221 aa11.81□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 PRR20CP86479 221 aa11.81□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 PRR20DP86480 221 aa11.81□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 PRR20BP86481 221 aa11.81□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 PRR20AP86496 221 aa11.81□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 LYPD8Q6UX82 237 aa11.81□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.81□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 KCNH2Q12809 1159 aa11.78□□□□□ -0.52
DMD-AS3-201ENST00000439592 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.53
DMD-AS3-201ENST00000439592 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.77□□□□□ -0.53
DMD-AS3-201ENST00000439592 MAP10Q9P2G4 905 aa11.77□□□□□ -0.53
DMD-AS3-201ENST00000439592 CTHP32929 405 aa11.76□□□□□ -0.53
DMD-AS3-201ENST00000439592 LINC01559Q495D7 138 aa11.75□□□□□ -0.53
DMD-AS3-201ENST00000439592 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
DMD-AS3-201ENST00000439592 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.75□□□□□ -0.53
DMD-AS3-201ENST00000439592 BAP1Q92560 729 aa11.75□□□□□ -0.53
DMD-AS3-201ENST00000439592 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.75□□□□□ -0.53
DMD-AS3-201ENST00000439592 FAM187AA6NFU0 413 aa11.74□□□□□ -0.53
DMD-AS3-201ENST00000439592 WNT7AO00755 349 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms