RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HERC3-206ENST00000431413 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.29■■□□□ 1.16
HERC3-206ENST00000431413 HRCP23327 699 aa22.29■■□□□ 1.16
HERC3-206ENST00000431413 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.29■■□□□ 1.16
HERC3-206ENST00000431413 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.29■■□□□ 1.16
HERC3-206ENST00000431413 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.29■■□□□ 1.16
HERC3-206ENST00000431413 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HERC3-206ENST00000431413 SIRT1Q96EB6 747 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-206ENST00000431413 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HERC3-206ENST00000431413 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-206ENST00000431413 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 MYOM2P54296 1465 aa22.26■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 LAMC1P11047 1609 aa22.25■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 AFF2P51816 1311 aa22.25■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 RXRBP28702 533 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 C8orf37Q96NL8 207 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 NUTM2FA1L443 756 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 NGLY1Q96IV0 654 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 STAC3Q96MF2 364 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-206ENST00000431413 FOXO3O43524 673 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-206ENST00000431413 ADAMTS2O95450 1211 aa22.2■■□□□ 1.14
HERC3-206ENST00000431413 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-206ENST00000431413 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HERC3-206ENST00000431413 POGKQ9P215 609 aa22.17■■□□□ 1.14
HERC3-206ENST00000431413 PRAM1Q96QH2 718 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-206ENST00000431413 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.16■■□□□ 1.14
HERC3-206ENST00000431413 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HERC3-206ENST00000431413 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 PXDNQ92626 1479 aa22.14■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 DLC1Q96QB1 1528 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 USP21Q9UK80 565 aa22.11■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 PSME1Q06323 249 aa22.1■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.1■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 KIF1AQ12756 1690 aa22.09■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HERC3-206ENST00000431413 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-206ENST00000431413 ADGRB1O14514 1584 aa22.07■■□□□ 1.12
HERC3-206ENST00000431413 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
HERC3-206ENST00000431413 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HERC3-206ENST00000431413 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.05■■□□□ 1.12
HERC3-206ENST00000431413 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HERC3-206ENST00000431413 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HERC3-206ENST00000431413 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HERC3-206ENST00000431413 RGS12O14924 1447 aa22.01■■□□□ 1.11
HERC3-206ENST00000431413 ADGRB2O60241 1585 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-206ENST00000431413 TNS3Q68CZ2 1445 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-206ENST00000431413 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-206ENST00000431413 SBNO1A3KN83 1393 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC3-206ENST00000431413 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HERC3-206ENST00000431413 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC3-206ENST00000431413 ARHGEF10O15013 1369 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC3-206ENST00000431413 ATRNO75882 1429 aa21.98■■□□□ 1.11
HERC3-206ENST00000431413 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC3-206ENST00000431413 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HERC3-206ENST00000431413 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.96■■□□□ 1.11
HERC3-206ENST00000431413 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-206ENST00000431413 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC3-206ENST00000431413 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-206ENST00000431413 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC3-206ENST00000431413 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-206ENST00000431413 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-206ENST00000431413 PLEKHG5O94827 1062 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-206ENST00000431413 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-206ENST00000431413 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-206ENST00000431413 USP32Q8NFA0 1604 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC3-206ENST00000431413 SLIT2O94813 1529 aa21.9■■□□□ 1.1
HERC3-206ENST00000431413 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HERC3-206ENST00000431413 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HERC3-206ENST00000431413 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-206ENST00000431413 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HERC3-206ENST00000431413 CDK19Q9BWU1 502 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC3-206ENST00000431413 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HERC3-206ENST00000431413 VPS72Q15906 364 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-206ENST00000431413 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC3-206ENST00000431413 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HERC3-206ENST00000431413 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.83■■□□□ 1.09
HERC3-206ENST00000431413 ATP7BP35670 1465 aa21.83■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.83■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 FAM83GA6ND36 823 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 CCDC125Q86Z20 511 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 ITSN1Q15811 1721 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 GLI3P10071 1580 aa21.78■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 ABCA3Q99758 1704 aa21.77■■□□□ 1.08
HERC3-206ENST00000431413 ALS2Q96Q42 1657 aa21.77■■□□□ 1.08
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