RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426585.5

TPTEP1-204, Transcript of TPTE pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TPTEP1, Length 5,725 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP1-204ENST00000426585 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.65■□□□□ 0.1
TPTEP1-204ENST00000426585 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TPTEP1-204ENST00000426585 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.64■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 IQGAP2Q13576 1575 aa15.63■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 NECTIN2Q92692 538 aa15.63■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 BCAR3O75815 825 aa15.63■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 MRE11P49959 708 aa15.63■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 MCTP1Q6DN14 999 aa15.63■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa15.63■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.62■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 BECN2A8MW95 431 aa15.62■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.61■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 RNF20Q5VTR2 975 aa15.61■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 WDR63Q8IWG1 891 aa15.61■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 TOMM22Q9NS69 142 aa15.61■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.6■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.6■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 GCC1Q96CN9 775 aa15.6■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.6■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 SMC3Q9UQE7 1217 aa15.6■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 ERC2O15083 957 aa15.59■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 RASSF8Q8NHQ8 419 aa15.59■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 PRKAR2BP31323 418 aa15.59■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.59■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 TRAK2O60296 914 aa15.59■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
TPTEP1-204ENST00000426585 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.57■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.57■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 ABCC5O15440 1437 aa15.56■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 NCOA1Q15788 1441 aa15.56■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.55■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 TPM3P06753 285 aa15.55■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 GNAI3P08754 354 aa15.55■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 NASPP49321 788 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 RABEP1Q15276 862 aa15.55■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 BICD2Q8TD16 824 aa15.55■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa15.55■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 SLFN5Q08AF3 891 aa15.54■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 PRAM1Q96QH2 718 aa15.54■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 CLSTN1O94985 981 aa15.54■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 PSME1Q06323 249 aa15.54■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.53■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 CREBRFQ8IUR6 639 aa15.53■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.53■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 GAS2L2Q8NHY3 880 aa15.53■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 MCM2P49736 904 aa15.52■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 CCDC30Q5VVM6 783 aa15.52■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
TPTEP1-204ENST00000426585 CNTROBQ8N137 903 aa15.52■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 TRIM29Q14134 588 aa15.51■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 C1orf115Q9H7X2 142 aa15.51■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.51■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 ARHGEF11O15085 1522 aa15.51■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 KIF14Q15058 1648 aa15.51■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.51■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 CPLX1O14810 134 aa15.51■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 MBD3O95983 291 aa15.51■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 CCDC39Q9UFE4 941 aa15.51■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 SASS6Q6UVJ0 657 aa15.5■□□□□ 0.07
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TPTEP1-204ENST00000426585 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 TPM1P09493 284 aa15.49■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 WWC1Q8IX03 1113 aa15.49■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 CDK19Q9BWU1 502 aa15.49■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.49■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 PSMA5P28066 241 aa15.48■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 ZNF592Q92610 1267 aa15.48■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 NEK4P51957 841 aa15.48■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 TRDNQ13061 729 aa15.48■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.48■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.48■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 GNAI2P04899 355 aa15.48■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.48■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 NLRP6P59044 892 aa15.47■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
TPTEP1-204ENST00000426585 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.47■□□□□ 0.07
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