RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 PLIN1O60240 522 aa13.49□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 REC8O95072 547 aa13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 RRP1P56182 461 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 COG6Q9Y2V7 657 aa13.48□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.258e-7■■□□□ 12.8
EFTUD2-202ENST00000426333 PANK3Q9H999 370 aa13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 SETQ01105 290 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa13.46□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.46□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO5CQ9NQX4 1742 aa13.46□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.46□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC70Q6NSX1 233 aa13.46□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13.46□□□□□ -0.25
EFTUD2-202ENST00000426333 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 G3V3G9 751 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 DCAF8Q5TAQ9 597 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 CRBNQ96SW2 442 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 CHMP5Q9NZZ3 219 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRL2O95490 1459 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 MCTP1Q6DN14 999 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS53Q5VIR6 699 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 RUFY2Q8WXA3 655 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.45□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF592Q92610 1267 aa13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa13.44□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 NUTM2FA1L443 756 aa13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 APAF1O14727 1248 aa13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 EID1Q9Y6B2 187 aa13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 TPM2P07951 284 aa13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX19BQ9UMR2 479 aa13.43□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 ROCK1Q13464 1354 aa13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM13BQ9NYF5 915 aa13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 NGEFQ8N5V2 710 aa13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 TEFQ10587 303 aa13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 CPLX1O14810 134 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 HOMER1Q86YM7 354 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 BICD2Q8TD16 824 aa13.41□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 NEXNQ0ZGT2 675 aa13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.4□□□□□ -0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM29Q14134 588 aa13.4□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 NCOA1Q15788 1441 aa13.39□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM43AQ8N2R8 423 aa13.39□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.39□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 NUCB2P80303 420 aa13.39□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.39□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX35Q5T0J7 233 aa13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 COG3Q96JB2 828 aa13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF20Q5VTR2 975 aa13.38□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 WWC1Q8IX03 1113 aa13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf141Q5JVX7 400 aa13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC144AA2RUR9 1427 aa13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCC1P33527 1531 aa13.35□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 TRDNQ13061 729 aa13.35□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 ARAP3Q8WWN8 1544 aa13.35□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 SMC3Q9UQE7 1217 aa13.35□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 PZPP20742 1482 aa13.35□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 EVC2Q86UK5 1308 aa13.35□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 APPP05067 770 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 SASS6Q6UVJ0 657 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 PLXNC1O60486 1568 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 PLCH2O75038 1416 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 USP47Q96K76 1375 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 OSCARQ8IYS5 282 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 LNPKQ9C0E8 428 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms