RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
PXDC1-202ENST00000380283 DDRGK1Q96HY6 314 aa34.64■■■■□ 3.14
PXDC1-202ENST00000380283 PANK3Q9H999 370 aa34.64■■■■□ 3.14
PXDC1-202ENST00000380283 NLRP1Q9C000 1473 aa34.63■■■■□ 3.13
PXDC1-202ENST00000380283 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
PXDC1-202ENST00000380283 IQGAP1P46940 1657 aa34.62■■■■□ 3.13
PXDC1-202ENST00000380283 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.62■■■■□ 3.13
PXDC1-202ENST00000380283 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
PXDC1-202ENST00000380283 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.6■■■■□ 3.13
PXDC1-202ENST00000380283 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
PXDC1-202ENST00000380283 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
PXDC1-202ENST00000380283 KDM2BQ8NHM5 1336 aa34.58■■■■□ 3.13
PXDC1-202ENST00000380283 TMF1P82094 1093 aa34.58■■■■□ 3.13
PXDC1-202ENST00000380283 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.58■■■■□ 3.13
PXDC1-202ENST00000380283 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.57■■■■□ 3.12
PXDC1-202ENST00000380283 ADGRB1O14514 1584 aa34.55■■■■□ 3.12
PXDC1-202ENST00000380283 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.55■■■■□ 3.12
PXDC1-202ENST00000380283 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
PXDC1-202ENST00000380283 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
PXDC1-202ENST00000380283 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.52■■■■□ 3.12
PXDC1-202ENST00000380283 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
PXDC1-202ENST00000380283 ADAMTS8Q9UP79 889 aa34.49■■■■□ 3.11
PXDC1-202ENST00000380283 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.49■■■■□ 3.11
PXDC1-202ENST00000380283 C20orf194Q5TEA3 1177 aa34.47■■■■□ 3.11
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF521Q96K83 1311 aa34.46■■■■□ 3.11
PXDC1-202ENST00000380283 DUSP27Q5VZP5 1158 aa34.46■■■■□ 3.11
PXDC1-202ENST00000380283 SKAP1Q86WV1 359 aa34.45■■■■□ 3.1
PXDC1-202ENST00000380283 ALKQ9UM73 1620 aa34.45■■■■□ 3.1
PXDC1-202ENST00000380283 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.44■■■■□ 3.1
PXDC1-202ENST00000380283 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.44■■■■□ 3.1
PXDC1-202ENST00000380283 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
PXDC1-202ENST00000380283 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.4■■■■□ 3.1
PXDC1-202ENST00000380283 LTKP29376 864 aa34.4■■■■□ 3.1
PXDC1-202ENST00000380283 IL27Q8NEV9 243 aa34.4■■■■□ 3.1
PXDC1-202ENST00000380283 PPP2R1AP30153 589 aa34.39■■■■□ 3.1
PXDC1-202ENST00000380283 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.38■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 STK26Q9P289 416 aa34.36■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 FAM161AQ3B820 660 aa34.36■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 EID1Q9Y6B2 187 aa34.36■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 PTPRMP28827 1452 aa34.36■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 SLC24A1O60721 1099 aa34.35■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 SLIT1O75093 1534 aa34.35■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP34.35■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 KNSTRNQ9Y448 316 aa34.35■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.34■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 GOLGA2Q08379 1002 aa34.34■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.34■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
PXDC1-202ENST00000380283 C8orf34Q49A92 452 aa34.32■■■■□ 3.08
PXDC1-202ENST00000380283 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa34.31■■■■□ 3.08
PXDC1-202ENST00000380283 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.31■■■■□ 3.08
PXDC1-202ENST00000380283 NFKBIBQ15653 356 aa34.3■■■■□ 3.08
PXDC1-202ENST00000380283 CDCA8Q53HL2 280 aa34.3■■■■□ 3.08
PXDC1-202ENST00000380283 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
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PXDC1-202ENST00000380283 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.29■■■■□ 3.08
PXDC1-202ENST00000380283 SLFN5Q08AF3 891 aa34.28■■■■□ 3.08
PXDC1-202ENST00000380283 MYOM1P52179 1685 aa34.28■■■■□ 3.08
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
PXDC1-202ENST00000380283 GSE1Q14687 1217 aa34.28■■■■□ 3.08
PXDC1-202ENST00000380283 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
PXDC1-202ENST00000380283 METP08581 1390 aa34.26■■■■□ 3.07
PXDC1-202ENST00000380283 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.23■■■■□ 3.07
PXDC1-202ENST00000380283 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.23■■■■□ 3.07
PXDC1-202ENST00000380283 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
PXDC1-202ENST00000380283 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.21■■■■□ 3.07
PXDC1-202ENST00000380283 PRAM1Q96QH2 718 aa34.21■■■■□ 3.07
PXDC1-202ENST00000380283 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
PXDC1-202ENST00000380283 ABCC11Q96J66 1382 aa34.19■■■■□ 3.06
PXDC1-202ENST00000380283 POGKQ9P215 609 aa34.18■■■■□ 3.06
PXDC1-202ENST00000380283 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.18■■■■□ 3.06
PXDC1-202ENST00000380283 SLC4A3P48751 1232 aa34.17■■■■□ 3.06
PXDC1-202ENST00000380283 MED14O60244 1454 aa34.15■■■■□ 3.06
PXDC1-202ENST00000380283 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.13■■■■□ 3.05
PXDC1-202ENST00000380283 DLC1Q96QB1 1528 aa34.13■■■■□ 3.05
PXDC1-202ENST00000380283 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
PXDC1-202ENST00000380283 TBX22Q9Y458 520 aa34.12■■■■□ 3.05
PXDC1-202ENST00000380283 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.11■■■■□ 3.05
PXDC1-202ENST00000380283 NGEFQ8N5V2 710 aa34.11■■■■□ 3.05
PXDC1-202ENST00000380283 EVC2Q86UK5 1308 aa34.1■■■■□ 3.05
PXDC1-202ENST00000380283 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.1■■■■□ 3.05
PXDC1-202ENST00000380283 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
PXDC1-202ENST00000380283 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
PXDC1-202ENST00000380283 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 E9PSI1 815 aa34.06■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 TECPR2O15040 1411 aa34.06■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 SIRT1Q96EB6 747 aa34.06■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 RGS3P49796 1198 aa34.05■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.05■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 APAF1O14727 1248 aa34.04■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.03■■■■□ 3.04
PXDC1-202ENST00000380283 CCDC146Q8IYE0 955 aa34.02■■■■□ 3.04
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