RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 ORAI2Q96SN7 254 aa34.54■■■■□ 3.12
FAAP20-201ENST00000378543 POTEAQ6S8J7 498 aa34.53■■■■□ 3.12
FAAP20-201ENST00000378543 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.53■■■■□ 3.12
FAAP20-201ENST00000378543 LAMC1P11047 1609 aa34.52■■■■□ 3.12
FAAP20-201ENST00000378543 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.52■■■■□ 3.12
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
FAAP20-201ENST00000378543 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
FAAP20-201ENST00000378543 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
FAAP20-201ENST00000378543 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
FAAP20-201ENST00000378543 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
FAAP20-201ENST00000378543 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
FAAP20-201ENST00000378543 SIRT1Q96EB6 747 aa34.43■■■■□ 3.1
FAAP20-201ENST00000378543 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.42■■■■□ 3.1
FAAP20-201ENST00000378543 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.41■■■■□ 3.1
FAAP20-201ENST00000378543 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.41■■■■□ 3.1
FAAP20-201ENST00000378543 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
FAAP20-201ENST00000378543 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.4■■■■□ 3.1
FAAP20-201ENST00000378543 NUTM2FA1L443 756 aa34.39■■■■□ 3.1
FAAP20-201ENST00000378543 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.38■■■■□ 3.09
FAAP20-201ENST00000378543 ADGRB1O14514 1584 aa34.36■■■■□ 3.09
FAAP20-201ENST00000378543 PRAM1Q96QH2 718 aa34.33■■■■□ 3.09
FAAP20-201ENST00000378543 DLC1Q96QB1 1528 aa34.32■■■■□ 3.08
FAAP20-201ENST00000378543 STAC3Q96MF2 364 aa34.32■■■■□ 3.08
FAAP20-201ENST00000378543 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.31■■■■□ 3.08
FAAP20-201ENST00000378543 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
FAAP20-201ENST00000378543 FOXO3O43524 673 aa34.29■■■■□ 3.08
FAAP20-201ENST00000378543 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
FAAP20-201ENST00000378543 PXDNQ92626 1479 aa34.28■■■■□ 3.08
FAAP20-201ENST00000378543 POGKQ9P215 609 aa34.27■■■■□ 3.08
FAAP20-201ENST00000378543 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.27■■■■□ 3.08
FAAP20-201ENST00000378543 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
FAAP20-201ENST00000378543 AFF2P51816 1311 aa34.25■■■■□ 3.07
FAAP20-201ENST00000378543 KIF1AQ12756 1690 aa34.23■■■■□ 3.07
FAAP20-201ENST00000378543 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
FAAP20-201ENST00000378543 C8orf37Q96NL8 207 aa34.22■■■■□ 3.07
FAAP20-201ENST00000378543 ADAMTS2O95450 1211 aa34.21■■■■□ 3.07
FAAP20-201ENST00000378543 ADGRB2O60241 1585 aa34.18■■■■□ 3.06
FAAP20-201ENST00000378543 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.15■■■■□ 3.06
FAAP20-201ENST00000378543 USP32Q8NFA0 1604 aa34.15■■■■□ 3.06
FAAP20-201ENST00000378543 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-201ENST00000378543 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-201ENST00000378543 NGLY1Q96IV0 654 aa34.13■■■■□ 3.05
FAAP20-201ENST00000378543 RXRBP28702 533 aa34.12■■■■□ 3.05
FAAP20-201ENST00000378543 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.12■■■■□ 3.05
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.1■■■■□ 3.05
FAAP20-201ENST00000378543 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.1■■■■□ 3.05
FAAP20-201ENST00000378543 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.09■■■■□ 3.05
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
FAAP20-201ENST00000378543 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
FAAP20-201ENST00000378543 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
FAAP20-201ENST00000378543 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.05■■■■□ 3.04
FAAP20-201ENST00000378543 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
FAAP20-201ENST00000378543 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.04■■■■□ 3.04
FAAP20-201ENST00000378543 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.03■■■■□ 3.04
FAAP20-201ENST00000378543 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
FAAP20-201ENST00000378543 PSME1Q06323 249 aa34.02■■■■□ 3.04
FAAP20-201ENST00000378543 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.02■■■■□ 3.04
FAAP20-201ENST00000378543 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.02■■■■□ 3.04
FAAP20-201ENST00000378543 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
FAAP20-201ENST00000378543 USP21Q9UK80 565 aa34.01■■■■□ 3.03
FAAP20-201ENST00000378543 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
FAAP20-201ENST00000378543 TNS3Q68CZ2 1445 aa34■■■■□ 3.03
FAAP20-201ENST00000378543 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
FAAP20-201ENST00000378543 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.98■■■■□ 3.03
FAAP20-201ENST00000378543 SBNO1A3KN83 1393 aa33.98■■■■□ 3.03
FAAP20-201ENST00000378543 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 RGS12O14924 1447 aa33.93■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 NEUROD1Q13562 356 aa33.92■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.91■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.91■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.91■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 ATP7BP35670 1465 aa33.9■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 ATRNO75882 1429 aa33.9■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 ITSN1Q15811 1721 aa33.9■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 PLEKHG5O94827 1062 aa33.89■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 ABCA3Q99758 1704 aa33.89■■■■□ 3.02
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGEF10O15013 1369 aa33.88■■■■□ 3.01
FAAP20-201ENST00000378543 CDK19Q9BWU1 502 aa33.88■■■■□ 3.01
FAAP20-201ENST00000378543 GPRASP1Q5JY77 1395 aa33.87■■■■□ 3.01
FAAP20-201ENST00000378543 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
FAAP20-201ENST00000378543 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
FAAP20-201ENST00000378543 ALS2Q96Q42 1657 aa33.86■■■■□ 3.01
FAAP20-201ENST00000378543 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.01
FAAP20-201ENST00000378543 SLIT2O94813 1529 aa33.84■■■■□ 3.01
FAAP20-201ENST00000378543 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa33.83■■■■□ 3.01
FAAP20-201ENST00000378543 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
FAAP20-201ENST00000378543 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa33.8■■■■□ 3
FAAP20-201ENST00000378543 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
FAAP20-201ENST00000378543 QRICH2Q9H0J4 1663 aa33.78■■■■□ 3
FAAP20-201ENST00000378543 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.78■■■■□ 3
FAAP20-201ENST00000378543 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC61Q9Y6R9 512 aa33.76■■■□□ 2.99
FAAP20-201ENST00000378543 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.76■■■□□ 2.99
FAAP20-201ENST00000378543 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
FAAP20-201ENST00000378543 NWD2Q9ULI1 1742 aa33.73■■■□□ 2.99
FAAP20-201ENST00000378543 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms