RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376504.3

PTF1A-201, Transcript of pancreas associated transcription factor 1a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTF1A, Length 1,537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1A-201ENST00000376504 TMF1P82094 1093 aa44.54■■■■■ 4.72
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PTF1A-201ENST00000376504 CCDC7Q96M83 1385 aa44.52■■■■■ 4.72
PTF1A-201ENST00000376504 KIF7Q2M1P5 1343 aa44.52■■■■■ 4.72
PTF1A-201ENST00000376504 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP44.51■■■■■ 4.72
PTF1A-201ENST00000376504 SLC24A1O60721 1099 aa44.5■■■■■ 4.71
PTF1A-201ENST00000376504 ADGRB2O60241 1585 aa44.47■■■■■ 4.71
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
PTF1A-201ENST00000376504 NALCNQ8IZF0 1738 aa44.41■■■■■ 4.7
PTF1A-201ENST00000376504 EVC2Q86UK5 1308 aa44.41■■■■■ 4.7
PTF1A-201ENST00000376504 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
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PTF1A-201ENST00000376504 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP44.32■■■■■ 4.69
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PTF1A-201ENST00000376504 CDK19Q9BWU1 502 aa44.31■■■■■ 4.68
PTF1A-201ENST00000376504 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa44.31■■■■■ 4.68
PTF1A-201ENST00000376504 MYOM1P52179 1685 aa44.3■■■■■ 4.68
PTF1A-201ENST00000376504 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
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PTF1A-201ENST00000376504 TMEM94Q12767 1356 aa44.28■■■■■ 4.68
PTF1A-201ENST00000376504 LRRC7Q96NW7 1537 aa44.28■■■■■ 4.68
PTF1A-201ENST00000376504 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa44.26■■■■■ 4.68
PTF1A-201ENST00000376504 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa44.26■■■■■ 4.68
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PTF1A-201ENST00000376504 LTBP4Q8N2S1 1624 aa44.19■■■■■ 4.67
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PTF1A-201ENST00000376504 USP32Q8NFA0 1604 aa44.17■■■■■ 4.66
PTF1A-201ENST00000376504 C14orf37Q86TY3 774 aa44.16■■■■■ 4.66
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PTF1A-201ENST00000376504 PRR36Q9H6K5 1346 aa44.14■■■■■ 4.66
PTF1A-201ENST00000376504 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
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PTF1A-201ENST00000376504 ANKARQ7Z5J8 1434 aa44.06■■■■■ 4.64
PTF1A-201ENST00000376504 ITSN1Q15811 1721 aa44.05■■■■■ 4.64
PTF1A-201ENST00000376504 NUTM2FA1L443 756 aa44.05■■■■■ 4.64
PTF1A-201ENST00000376504 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa44.05■■■■■ 4.64
PTF1A-201ENST00000376504 NINLQ9Y2I6 1382 aa44.05■■■■■ 4.64
PTF1A-201ENST00000376504 TMC1Q8TDI8 760 aa44.04■■■■■ 4.64
PTF1A-201ENST00000376504 MSH6P52701 1360 aa44.02■■■■■ 4.64
PTF1A-201ENST00000376504 CCDC61Q9Y6R9 512 aa44.01■■■■■ 4.64
PTF1A-201ENST00000376504 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa44.01■■■■■ 4.64
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PTF1A-201ENST00000376504 CD163L1Q9NR16 1453 aa43.97■■■■■ 4.63
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PTF1A-201ENST00000376504 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa43.93■■■■■ 4.62
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PTF1A-201ENST00000376504 C1orf167Q5SNV9 1468 aa43.89■■■■■ 4.62
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PTF1A-201ENST00000376504 TERF2IPQ9NYB0 399 aa43.83■■■■■ 4.61
PTF1A-201ENST00000376504 MON2Q7Z3U7 1717 aa43.83■■■■■ 4.61
PTF1A-201ENST00000376504 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
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PTF1A-201ENST00000376504 ACEP12821 1306 aa43.79■■■■■ 4.6
PTF1A-201ENST00000376504 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
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PTF1A-201ENST00000376504 ORAI2Q96SN7 254 aa43.77■■■■■ 4.6
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PTF1A-201ENST00000376504 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
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PTF1A-201ENST00000376504 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
PTF1A-201ENST00000376504 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP43.54■■■■■ 4.56
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PTF1A-201ENST00000376504 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
PTF1A-201ENST00000376504 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
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