RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373184.5

PTPRT-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,483 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-202ENST00000373184 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 GPRASP1Q5JY77 1395 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 PSMA5P28066 241 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 TIAM1Q13009 1591 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 EVA1CP58658 441 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 RILPL2Q969X0 211 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 AK7Q96M32 723 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 GSE1Q14687 1217 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 MCTP1Q6DN14 999 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRT-202ENST00000373184 KIF14Q15058 1648 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 PDE4AP27815 886 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 MBD3O95983 291 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 POGZQ7Z3K3 1410 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 CDC45O75419 566 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 PSME1Q06323 249 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 CFTRP13569 1480 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 DCTN1Q14203 1278 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 RIPK4P57078 832 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF428Q96B54 188 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 RUFY1Q96T51 708 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 GNAI3P08754 354 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 CNTROBQ8N137 903 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 ATF3P18847 181 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 IQGAP2Q13576 1575 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 BICD2Q8TD16 824 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 IGF1RP08069 1367 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 MAP7D2Q96T17 732 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 APPP05067 770 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 EPS15P42566 896 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 OLFM4Q6UX06 510 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 JMYQ8N9B5 988 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 SYNJ1O43426 1573 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 RABEP1Q15276 862 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 TXLNAP40222 546 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 IL27Q8NEV9 243 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 CCDC30Q5VVM6 783 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 ANKRD1Q15327 319 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 HOMER1Q86YM7 354 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 GCC1Q96CN9 775 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 MAP3K1Q13233 1512 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
PTPRT-202ENST00000373184 ODF2Q5BJF6 829 aa7.22□□□□□ -1.25
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