RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 BCAR3O75815 825 aa25.47■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 NCOA1Q15788 1441 aa25.47■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 GSE1Q14687 1217 aa25.47■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 PDE3AQ14432 1141 aa25.46■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.46■■□□□ 1.67
NISCH-201ENST00000345716 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 TOMM22Q9NS69 142 aa25.45■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 KIF3AQ9Y496 699 aa25.45■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 KIF14Q15058 1648 aa25.45■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.45■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.44■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 PHF14O94880 888 aa25.42■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.42■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 ABTB2Q8N961 1025 aa25.42■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.42■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 ATF3P18847 181 aa25.41■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.661e-8■□□□□ 10.7
NISCH-201ENST00000345716 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.4■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.4■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 WDR63Q8IWG1 891 aa25.4■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
NISCH-201ENST00000345716 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.39■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.38■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.38■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 H3BQV1 296 aa25.38■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 IFFO2Q5TF58 517 aa25.38■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.37■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 TPM4P67936 248 aa25.37■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.37■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.36■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.36■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.36■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.35■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 CDC45O75419 566 aa25.35■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.35■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.34■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.34■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.33■■□□□ 1.65
NISCH-201ENST00000345716 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.31■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 CD109Q6YHK3 1445 aa25.31■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 GNAI3P08754 354 aa25.31■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.31■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 ERC2O15083 957 aa25.3■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.3■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 ADGRL1O94910 1474 aa25.3■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 SLFN5Q08AF3 891 aa25.28■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.28■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 RNF20Q5VTR2 975 aa25.28■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.27■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 WWC1Q8IX03 1113 aa25.27■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 NFKBIBQ15653 356 aa25.27■■□□□ 1.64
NISCH-201ENST00000345716 PTPRKQ15262 1439 aa25.26■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 G3V3G9 751 aa25.26■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.26■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 GCC1Q96CN9 775 aa25.26■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.25■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.25■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 SLC4A2P04920 1241 aa25.25■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 NUCB2P80303 420 aa25.25■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 BACH2Q9BYV9 841 aa25.24■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 MCTP1Q6DN14 999 aa25.24■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 FCHSD2O94868 740 aa25.24■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.21■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
NISCH-201ENST00000345716 APPP05067 770 aa25.2■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.2■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.2■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 CLSTN1O94985 981 aa25.2■■□□□ 1.62
NISCH-201ENST00000345716 GNAI2P04899 355 aa25.2■■□□□ 1.62
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