RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 WDR63Q8IWG1 891 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 NFKBIBQ15653 356 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 KDM5CP41229 1560 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 INSRP06213 1382 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 A2MP01023 1474 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 OSCARQ8IYS5 282 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 MBD5Q9P267 1494 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 WWC1Q8IX03 1113 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 ABCA8O94911 1581 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 RIPK4P57078 832 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 CABP2Q9NPB3 220 aa15.29■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 22.5
PTPRG-201ENST00000295874 ADGRL1O94910 1474 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 KIF16BQ96L93 1317 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 CYB5RLQ6IPT4 315 aa15.28■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 GBP4Q96PP9 640 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRG-201ENST00000295874 PTMSP20962 102 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 FANCAO15360 1455 aa15.26■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.25■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 CALRP27797 417 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 PIK3C2GO75747 1445 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 ABCC2Q92887 1545 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.24■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 DRC7Q8IY82 874 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.23■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 GORABQ5T7V8 394 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa15.22■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 COG3Q96JB2 828 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
PTPRG-201ENST00000295874 SKAP1Q86WV1 359 aa15.21■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 EVA1CP58658 441 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 ANKRD45Q5TZF3 282 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 RARSP54136 660 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 GNAI1P63096 354 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 NOS1P29475 1434 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 DDX11L8A8MPP1 907 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 CHMP5Q9NZZ3 219 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 HMMRO75330 724 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 PRAM1Q96QH2 718 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 NSD2O96028 1365 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 MCCP23508 829 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 CD109Q6YHK3 1445 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 KLHL34Q8N239 644 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 APBB1O00213 710 aa15.15■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.02
PTPRG-201ENST00000295874 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
PTPRG-201ENST00000295874 STK31Q9BXU1 1019 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRG-201ENST00000295874 LNPKQ9C0E8 428 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRG-201ENST00000295874 PREX2Q70Z35 1606 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRG-201ENST00000295874 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.14■□□□□ 0.01
PTPRG-201ENST00000295874 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms