RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 NLRP1Q9C000 1473 aa19.57■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 TXNDC2Q86VQ3 553 aa19.56■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.56■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 METP08581 1390 aa19.56■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 CDK19Q9BWU1 502 aa19.56■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 UBR1Q8IWV7 1749 aa19.56■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.55■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 MORC1Q86VD1 984 aa19.55■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 EID1Q9Y6B2 187 aa19.55■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 C3P01024 1663 aa19.55■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 ABCC11Q96J66 1382 aa19.54■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.54■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 LTKP29376 864 aa19.54■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 ATAD2Q6PL18 1390 aa19.53■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa19.53■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.52■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.52■□□□□ 0.72
NICN1-201ENST00000273598 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa19.51■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 TERF2IPQ9NYB0 399 aa19.51■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 NINLQ9Y2I6 1382 aa19.5■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 DLC1Q96QB1 1528 aa19.5■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 SLC26A8Q96RN1 970 aa19.49■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 CABP1Q9NZU7 370 aa19.48■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 NUDCQ9Y266 331 aa19.48■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 A0A1W2PP64 1363 aa19.47■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa19.47■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
NICN1-201ENST00000273598 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa19.45■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 WASLO00401 505 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 INSRP06213 1382 aa19.44■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 SIRT1Q96EB6 747 aa19.43■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 GGNBP2Q9H3C7 697 aa19.42■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.42■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 NSD2O96028 1365 aa19.42■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 MTHFSP49914 203 aa19.4■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 TECPR2O15040 1411 aa19.4■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 SLIT1O75093 1534 aa19.4■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.4■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 USP32Q8NFA0 1604 aa19.4■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 PDE3BQ13370 1112 aa19.39■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.39■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 ARHGAP23Q9P227 1491 aa19.39■□□□□ 0.7
NICN1-201ENST00000273598 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 CFAP53Q96M91 514 aa19.38■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 FYB1O15117 783 aa19.38■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.38■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.38■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 TBX22Q9Y458 520 aa19.38■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 CD163L1Q9NR16 1453 aa19.38■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.37■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 CPS1P31327 1500 aa19.36■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.36■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.36■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa19.35■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa19.35■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 NUTM2FA1L443 756 aa19.34■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 MED14O60244 1454 aa19.34■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 APAF1O14727 1248 aa19.33■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 PTPRUQ92729 1446 aa19.33■□□□□ 0.69
NICN1-201ENST00000273598 ANKLE2Q86XL3 938 aa19.32■□□□□ 0.68
NICN1-201ENST00000273598 ATP7BP35670 1465 aa19.32■□□□□ 0.68
NICN1-201ENST00000273598 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.29■□□□□ 0.68
NICN1-201ENST00000273598 PRR36Q9H6K5 1346 aa19.28■□□□□ 0.68
NICN1-201ENST00000273598 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.28■□□□□ 0.68
NICN1-201ENST00000273598 ERICH6BQ5W0A0 696 aa19.27■□□□□ 0.68
NICN1-201ENST00000273598 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
NICN1-201ENST00000273598 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.27■□□□□ 0.68
NICN1-201ENST00000273598 GOLGA2Q08379 1002 aa19.27■□□□□ 0.68
NICN1-201ENST00000273598 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 KCNA6P17658 529 aa19.25■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 NME9Q86XW9 330 aa19.25■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 NEUROD2Q15784 382 aa19.25■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 DIP2AQ14689 1571 aa19.25■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 RUNDC1Q96C34 613 aa19.24■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 FBLN1P23142 703 aa19.23■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 PPP4R2Q9NY27 417 aa19.23■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.23■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 PTCH1Q13635 1447 aa19.23■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 KIF20BQ96Q89 1820 aa19.22■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 COG3Q96JB2 828 aa19.22■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 ACEP12821 1306 aa19.22■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 ZNF521Q96K83 1311 aa19.22■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 SHPRHQ149N8 1683 aa19.22■□□□□ 0.67
NICN1-201ENST00000273598 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms