RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
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CLSTN3-201ENST00000266546 PRAM1Q96QH2 718 aa14.66□□□□□ -0.06
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CLSTN3-201ENST00000266546 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.66□□□□□ -0.06
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CLSTN3-201ENST00000266546 ADGRB3O60242 1522 aa14.53□□□□□ -0.08
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CLSTN3-201ENST00000266546 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.5□□□□□ -0.09
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CLSTN3-201ENST00000266546 NLRP1Q9C000 1473 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-201ENST00000266546 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-201ENST00000266546 SIRT1Q96EB6 747 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.49□□□□□ -0.09
CLSTN3-201ENST00000266546 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLSTN3-201ENST00000266546 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLSTN3-201ENST00000266546 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.48□□□□□ -0.09
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CLSTN3-201ENST00000266546 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.48□□□□□ -0.09
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