RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
PITX1-201ENST00000265340 MYOM2P54296 1465 aa28.31■■■□□ 2.12
PITX1-201ENST00000265340 ADGRB3O60242 1522 aa28.3■■■□□ 2.12
PITX1-201ENST00000265340 POGKQ9P215 609 aa28.3■■■□□ 2.12
PITX1-201ENST00000265340 TPM2P07951 284 aa28.29■■■□□ 2.12
PITX1-201ENST00000265340 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.29■■■□□ 2.12
PITX1-201ENST00000265340 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PITX1-201ENST00000265340 TMF1P82094 1093 aa28.28■■■□□ 2.12
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.27■■■□□ 2.12
PITX1-201ENST00000265340 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PITX1-201ENST00000265340 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
PITX1-201ENST00000265340 C3P01024 1663 aa28.25■■■□□ 2.11
PITX1-201ENST00000265340 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.24■■■□□ 2.11
PITX1-201ENST00000265340 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.24■■■□□ 2.11
PITX1-201ENST00000265340 PIK3C2BO00750 1634 aa28.23■■■□□ 2.11
PITX1-201ENST00000265340 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.23■■■□□ 2.11
PITX1-201ENST00000265340 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.23■■■□□ 2.11
PITX1-201ENST00000265340 TNRQ92752 1358 aa28.2■■■□□ 2.11
PITX1-201ENST00000265340 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
PITX1-201ENST00000265340 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 PANK3Q9H999 370 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.2■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 RGS3P49796 1198 aa28.19■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 PPLO60437 1756 aa28.18■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 RALBP1Q15311 655 aa28.17■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.16■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.15■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
PITX1-201ENST00000265340 FSD2A1L4K1 749 aa28.13■■■□□ 2.09
PITX1-201ENST00000265340 TMC1Q8TDI8 760 aa28.13■■■□□ 2.09
PITX1-201ENST00000265340 PIK3C2GO75747 1445 aa28.12■■■□□ 2.09
PITX1-201ENST00000265340 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PITX1-201ENST00000265340 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.11■■■□□ 2.09
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa28.1■■■□□ 2.09
PITX1-201ENST00000265340 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PITX1-201ENST00000265340 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
PITX1-201ENST00000265340 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
PITX1-201ENST00000265340 FAM161AQ3B820 660 aa28.08■■■□□ 2.09
PITX1-201ENST00000265340 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.07■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.07■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 PTPRMP28827 1452 aa28.06■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.05■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 ESPNB1AK53 854 aa28.05■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.05■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.05■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 MYOM1P52179 1685 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 ADGRB1O14514 1584 aa28.04■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.03■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 CDCA8Q53HL2 280 aa28.03■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 C8orf34Q49A92 452 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 NLRP13Q86W25 1043 aa28.02■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
PITX1-201ENST00000265340 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.01■■■□□ 2.07
PITX1-201ENST00000265340 MAP7D2Q96T17 732 aa28■■■□□ 2.07
PITX1-201ENST00000265340 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28■■■□□ 2.07
PITX1-201ENST00000265340 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
PITX1-201ENST00000265340 PANK2Q9BZ23 570 aa27.99■■■□□ 2.07
PITX1-201ENST00000265340 NLRP1Q9C000 1473 aa27.99■■■□□ 2.07
PITX1-201ENST00000265340 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PITX1-201ENST00000265340 SKAP1Q86WV1 359 aa27.97■■■□□ 2.07
PITX1-201ENST00000265340 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.97■■■□□ 2.07
PITX1-201ENST00000265340 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
PITX1-201ENST00000265340 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
PITX1-201ENST00000265340 MRE11P49959 708 aa27.94■■■□□ 2.06
PITX1-201ENST00000265340 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.94■■■□□ 2.06
PITX1-201ENST00000265340 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.94■■■□□ 2.06
PITX1-201ENST00000265340 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.94■■■□□ 2.06
PITX1-201ENST00000265340 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.92■■■□□ 2.06
PITX1-201ENST00000265340 ERBB4Q15303 1308 aa27.92■■■□□ 2.06
PITX1-201ENST00000265340 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.9■■■□□ 2.06
PITX1-201ENST00000265340 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
PITX1-201ENST00000265340 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.89■■■□□ 2.06
PITX1-201ENST00000265340 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 ZFYVE9O95405 1425 aa27.88■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 TERF1P54274 439 aa27.88■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.88■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.87■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 LTKP29376 864 aa27.87■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 PDE3BQ13370 1112 aa27.87■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.87■■■□□ 2.05
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PITX1-201ENST00000265340 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 BECN1Q14457 450 aa27.84■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.84■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.84■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.84■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 ARXQ96QS3 562 aa27.84■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
PITX1-201ENST00000265340 NCLP19338 710 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 PPP2R1AP30153 589 aa27.82■■■□□ 2.04
PITX1-201ENST00000265340 CRBNQ96SW2 442 aa27.82■■■□□ 2.04
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