RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.43■■■■□ 3.42
TOMM40-201ENST00000252487 TMF1P82094 1093 aa36.42■■■■□ 3.42
TOMM40-201ENST00000252487 SIRT1Q96EB6 747 aa36.42■■■■□ 3.42
TOMM40-201ENST00000252487 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
TOMM40-201ENST00000252487 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.4■■■■□ 3.42
TOMM40-201ENST00000252487 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
TOMM40-201ENST00000252487 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.32■■■■□ 3.4
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TOMM40-201ENST00000252487 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
TOMM40-201ENST00000252487 EVC2Q86UK5 1308 aa36.29■■■■□ 3.4
TOMM40-201ENST00000252487 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.29■■■■□ 3.4
TOMM40-201ENST00000252487 CABP2Q9NPB3 220 aa36.27■■■■□ 3.4
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TOMM40-201ENST00000252487 CDK19Q9BWU1 502 aa36.25■■■■□ 3.39
TOMM40-201ENST00000252487 SLC24A1O60721 1099 aa36.23■■■■□ 3.39
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TOMM40-201ENST00000252487 MYOM1P52179 1685 aa36.22■■■■□ 3.39
TOMM40-201ENST00000252487 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
TOMM40-201ENST00000252487 CDCA8Q53HL2 280 aa36.21■■■■□ 3.39
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM94Q12767 1356 aa36.18■■■■□ 3.38
TOMM40-201ENST00000252487 C14orf37Q86TY3 774 aa36.17■■■■□ 3.38
TOMM40-201ENST00000252487 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.17■■■■□ 3.38
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TOMM40-201ENST00000252487 NUTM2FA1L443 756 aa36.14■■■■□ 3.38
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TOMM40-201ENST00000252487 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.1■■■■□ 3.37
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TOMM40-201ENST00000252487 TMC1Q8TDI8 760 aa36.1■■■■□ 3.37
TOMM40-201ENST00000252487 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.1■■■■□ 3.37
TOMM40-201ENST00000252487 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.1■■■■□ 3.37
TOMM40-201ENST00000252487 USP32Q8NFA0 1604 aa36.08■■■■□ 3.37
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TOMM40-201ENST00000252487 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.07■■■■□ 3.36
TOMM40-201ENST00000252487 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.06■■■■□ 3.36
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TOMM40-201ENST00000252487 PANK3Q9H999 370 aa36.03■■■■□ 3.36
TOMM40-201ENST00000252487 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.01■■■■□ 3.35
TOMM40-201ENST00000252487 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36■■■■□ 3.35
TOMM40-201ENST00000252487 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36■■■■□ 3.35
TOMM40-201ENST00000252487 C19orf44Q9H6X5 657 aa36■■■■□ 3.35
TOMM40-201ENST00000252487 CABP1Q9NZU7 370 aa36■■■■□ 3.35
TOMM40-201ENST00000252487 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.95■■■■□ 3.35
TOMM40-201ENST00000252487 MSH6P52701 1360 aa35.94■■■■□ 3.34
TOMM40-201ENST00000252487 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.94■■■■□ 3.34
TOMM40-201ENST00000252487 ITSN1Q15811 1721 aa35.93■■■■□ 3.34
TOMM40-201ENST00000252487 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.93■■■■□ 3.34
TOMM40-201ENST00000252487 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.91■■■■□ 3.34
TOMM40-201ENST00000252487 ATF3P18847 181 aa35.91■■■■□ 3.34
TOMM40-201ENST00000252487 A0A1W2PP64 1363 aa35.9■■■■□ 3.34
TOMM40-201ENST00000252487 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.9■■■■□ 3.34
TOMM40-201ENST00000252487 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
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TOMM40-201ENST00000252487 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.89■■■■□ 3.34
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TOMM40-201ENST00000252487 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
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TOMM40-201ENST00000252487 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.84■■■■□ 3.33
TOMM40-201ENST00000252487 AKAP12Q02952 1782 aa35.83■■■■□ 3.33
TOMM40-201ENST00000252487 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.83■■■■□ 3.33
TOMM40-201ENST00000252487 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.83■■■■□ 3.33
TOMM40-201ENST00000252487 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.82■■■■□ 3.32
TOMM40-201ENST00000252487 ORAI2Q96SN7 254 aa35.82■■■■□ 3.32
TOMM40-201ENST00000252487 ACEP12821 1306 aa35.81■■■■□ 3.32
TOMM40-201ENST00000252487 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.81■■■■□ 3.32
TOMM40-201ENST00000252487 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
TOMM40-201ENST00000252487 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
TOMM40-201ENST00000252487 KNSTRNQ9Y448 316 aa35.78■■■■□ 3.32
TOMM40-201ENST00000252487 PHF8Q9UPP1 1060 aa35.77■■■■□ 3.32
TOMM40-201ENST00000252487 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.77■■■■□ 3.32
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TOMM40-201ENST00000252487 ANP32CO43423 234 aa35.69■■■■□ 3.3
TOMM40-201ENST00000252487 USP6P35125 1406 aa35.69■■■■□ 3.3
TOMM40-201ENST00000252487 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.69■■■■□ 3.3
TOMM40-201ENST00000252487 KIF1AQ12756 1690 aa35.68■■■■□ 3.3
TOMM40-201ENST00000252487 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
TOMM40-201ENST00000252487 FOXO3O43524 673 aa35.65■■■■□ 3.3
TOMM40-201ENST00000252487 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
TOMM40-201ENST00000252487 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
TOMM40-201ENST00000252487 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.64■■■■□ 3.3
TOMM40-201ENST00000252487 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
TOMM40-201ENST00000252487 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.63■■■■□ 3.29
TOMM40-201ENST00000252487 BRINP3Q76B58 766 aa35.62■■■■□ 3.29
TOMM40-201ENST00000252487 SSH2Q76I76 1423 aa35.6■■■■□ 3.29
TOMM40-201ENST00000252487 NME9Q86XW9 330 aa35.6■■■■□ 3.29
TOMM40-201ENST00000252487 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.59■■■■□ 3.29
TOMM40-201ENST00000252487 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.59■■■■□ 3.29
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