RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 NHSL1Q5SYE7 1610 aa44.43■■■■■ 4.7
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INO80B-201ENST00000233331 JCADQ9P266 1359 aa44.43■■■■■ 4.7
INO80B-201ENST00000233331 SIN3AQ96ST3 1273 aa44.42■■■■■ 4.7
INO80B-201ENST00000233331 PRAM1Q96QH2 718 aa44.39■■■■■ 4.7
INO80B-201ENST00000233331 ORAI2Q96SN7 254 aa44.36■■■■■ 4.69
INO80B-201ENST00000233331 TRAK1Q9UPV9 953 aa44.36■■■■■ 4.69
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INO80B-201ENST00000233331 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
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INO80B-201ENST00000233331 ARHGEF10O15013 1369 aa43.66■■■■■ 4.58
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INO80B-201ENST00000233331 PLEKHG3A1L390 1219 aa43.55■■■■■ 4.56
INO80B-201ENST00000233331 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
INO80B-201ENST00000233331 CABLES1Q8TDN4 633 aa43.55■■■■■ 4.56
INO80B-201ENST00000233331 ABCA3Q99758 1704 aa43.54■■■■■ 4.56
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INO80B-201ENST00000233331 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
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INO80B-201ENST00000233331 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
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