RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000214869.6

TMED1-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED1, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1-201ENST00000214869 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.77■■□□□ 1.08
TMED1-201ENST00000214869 EVC2Q86UK5 1308 aa21.77■■□□□ 1.08
TMED1-201ENST00000214869 STRCQ7RTU9 1775 aa21.77■■□□□ 1.07
TMED1-201ENST00000214869 ADGRB2O60241 1585 aa21.76■■□□□ 1.07
TMED1-201ENST00000214869 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.76■■□□□ 1.07
TMED1-201ENST00000214869 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.75■■□□□ 1.07
TMED1-201ENST00000214869 NWD1Q149M9 1564 aa21.75■■□□□ 1.07
TMED1-201ENST00000214869 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.74■■□□□ 1.07
TMED1-201ENST00000214869 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TMED1-201ENST00000214869 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.73■■□□□ 1.07
TMED1-201ENST00000214869 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
TMED1-201ENST00000214869 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
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TMED1-201ENST00000214869 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.67■■□□□ 1.06
TMED1-201ENST00000214869 MIER1Q8N108 512 aa21.67■■□□□ 1.06
TMED1-201ENST00000214869 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.66■■□□□ 1.06
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TMED1-201ENST00000214869 CDK19Q9BWU1 502 aa21.65■■□□□ 1.06
TMED1-201ENST00000214869 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
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TMED1-201ENST00000214869 PANK3Q9H999 370 aa21.63■■□□□ 1.05
TMED1-201ENST00000214869 ANP32CO43423 234 aa21.62■■□□□ 1.05
TMED1-201ENST00000214869 CABP2Q9NPB3 220 aa21.62■■□□□ 1.05
TMED1-201ENST00000214869 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.61■■□□□ 1.05
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TMED1-201ENST00000214869 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.6■■□□□ 1.05
TMED1-201ENST00000214869 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.59■■□□□ 1.05
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TMED1-201ENST00000214869 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.58■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 USP32Q8NFA0 1604 aa21.58■■□□□ 1.04
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TMED1-201ENST00000214869 ATP7BP35670 1465 aa21.57■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.57■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.56■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.56■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 ITSN1Q15811 1721 aa21.56■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.55■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.54■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 CCER2I3L3R5 266 aa21.54■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 TMC1Q8TDI8 760 aa21.54■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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TMED1-201ENST00000214869 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.53■■□□□ 1.04
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TMED1-201ENST00000214869 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.53■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 AKAP12Q02952 1782 aa21.52■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.52■■□□□ 1.04
TMED1-201ENST00000214869 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.03
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TMED1-201ENST00000214869 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.5■■□□□ 1.03
TMED1-201ENST00000214869 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TMED1-201ENST00000214869 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.5■■□□□ 1.03
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TMED1-201ENST00000214869 A0A1W2PP64 1363 aa21.5■■□□□ 1.03
TMED1-201ENST00000214869 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.49■■□□□ 1.03
TMED1-201ENST00000214869 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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TMED1-201ENST00000214869 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TMED1-201ENST00000214869 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.48■■□□□ 1.03
TMED1-201ENST00000214869 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.47■■□□□ 1.03
TMED1-201ENST00000214869 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TMED1-201ENST00000214869 DCCP43146 1447 aa21.45■■□□□ 1.02
TMED1-201ENST00000214869 NSD2O96028 1365 aa21.44■■□□□ 1.02
TMED1-201ENST00000214869 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.44■■□□□ 1.02
TMED1-201ENST00000214869 TMEM94Q12767 1356 aa21.43■■□□□ 1.02
TMED1-201ENST00000214869 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.43■■□□□ 1.02
TMED1-201ENST00000214869 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TMED1-201ENST00000214869 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.42■■□□□ 1.02
TMED1-201ENST00000214869 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.42■■□□□ 1.02
TMED1-201ENST00000214869 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.42■■□□□ 1.02
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TMED1-201ENST00000214869 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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TMED1-201ENST00000214869 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.4■■□□□ 1.02
TMED1-201ENST00000214869 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 C14orf37Q86TY3 774 aa21.38■■□□□ 1.01
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TMED1-201ENST00000214869 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.37■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 ACEP12821 1306 aa21.36■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 SSH2Q76I76 1423 aa21.36■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 KIF1AQ12756 1690 aa21.34■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 USP6P35125 1406 aa21.34■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 NUTM2FA1L443 756 aa21.34■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 NLRP13Q86W25 1043 aa21.34■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 CERKQ8TCT0 537 aa21.34■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 MSH6P52701 1360 aa21.33■■□□□ 1.01
TMED1-201ENST00000214869 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.33■■□□□ 1
TMED1-201ENST00000214869 MST1RQ04912 1400 aa21.33■■□□□ 1
TMED1-201ENST00000214869 FYB1O15117 783 aa21.32■■□□□ 1
TMED1-201ENST00000214869 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.31■■□□□ 1
TMED1-201ENST00000214869 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.31■■□□□ 1
TMED1-201ENST00000214869 ATF3P18847 181 aa21.3■■□□□ 1
TMED1-201ENST00000214869 PPP2R1AP30153 589 aa21.3■■□□□ 1
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