RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa28.42■■■□□ 2.14
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GsdmaQ9EST1 446 aa28.26■■■□□ 2.11
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AglF8VPN4 1532 aa28.24■■■□□ 2.11
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mre11Q61216 706 aa28.23■■■□□ 2.11
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim58Q5NCC9 485 aa28.23■■■□□ 2.11
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttc37F8VPK0 1563 aa28.18■■■□□ 2.1
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nrxn1Q9CS84 1514 aa28.14■■■□□ 2.1
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ak7Q9D2H2 614 aa28.14■■■□□ 2.09
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rlbp1Q9Z275 317 aa28.11■■■□□ 2.09
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc183A2AJB1 534 aa28.11■■■□□ 2.09
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Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 4933416C03RikQ3V063 378 aa27.96■■■□□ 2.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atl3Q91YH5 541 aa27.93■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dusp27Q148W8 1138 aa27.92■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa27.92■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf541Q0GGX2 1363 aa27.91■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Qser1A2BIE1 1698 aa27.91■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ciz1Q8VEH2 845 aa27.9■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stk26Q99JT2 416 aa27.89■■■□□ 2.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim26Q99PN3 545 aa27.89■■■□□ 2.06
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