RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
Q0143Q0143 PAU5P43575 122 aa-7.34□□□□□ -3.58
Q0143Q0143 CMC2Q3E7A4 109 aa-7.35□□□□□ -3.59
Q0143Q0143 TIM12P32830 109 aa-7.36□□□□□ -3.59
Q0143Q0143 FLO1P32768 1537 aa-7.37□□□□□ -3.59
Q0143Q0143 RPS20P38701 121 aaKnown RBP-7.38□□□□□ -3.59
Q0143Q0143 SMC4Q12267 1418 aa-7.4□□□□□ -3.59
Q0143Q0143 CHD1P32657 1468 aa-7.42□□□□□ -3.6
Q0143Q0143 GCN2P15442 1659 aa-7.42□□□□□ -3.6
Q0143Q0143 YAL065CO13511 128 aa-7.43□□□□□ -3.6
Q0143Q0143 RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP-7.43□□□□□ -3.6
Q0143Q0143 RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP-7.43□□□□□ -3.6
Q0143Q0143 FKS3Q04952 1785 aa-7.43□□□□□ -3.6
Q0143Q0143 KSH1Q8TGJ3 72 aa-7.44□□□□□ -3.6
Q0143Q0143 SPC1P46965 94 aa-7.45□□□□□ -3.6
Q0143Q0143 LSM2P38203 95 aaKnown RBP-7.47□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 GDB1Q06625 1536 aa-7.47□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 DNF1P32660 1571 aa-7.49□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP-7.49□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 PAU17Q12370 124 aa-7.49□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 YAR029WP39549 74 aa-7.5□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 SWC7Q06707 132 aa-7.5□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 KRE5P22023 1365 aa-7.5□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 SIN3P22579 1536 aa-7.51□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa-7.51□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 RPB11P38902 120 aa-7.52□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 EMC5P40540 141 aa-7.52□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 YDR278CQ05612 105 aa-7.52□□□□□ -3.61
Q0143Q0143 PAU23Q07987 124 aa-7.55□□□□□ -3.62
Q0143Q0143 SPI1P40092 148 aa-7.56□□□□□ -3.62
Q0143Q0143 KOG1P38873 1557 aa-7.59□□□□□ -3.62
Q0143Q0143 YBR200W-AQ3E755 54 aa-7.59□□□□□ -3.62
Q0143Q0143 CDC25P04821 1589 aa-7.59□□□□□ -3.62
Q0143Q0143 NUP159P40477 1460 aa-7.6□□□□□ -3.63
Q0143Q0143 ATG38Q05789 226 aaKnown RBP-7.6□□□□□ -3.63
Q0143Q0143 YIL156W-BQ2V2P4 73 aa-7.6□□□□□ -3.63
Q0143Q0143 YOR316C-AQ3E806 69 aa-7.62□□□□□ -3.63
Q0143Q0143 RPA190P10964 1664 aaKnown RBP-7.63□□□□□ -3.63
Q0143Q0143 MRP49P32388 137 aa-7.63□□□□□ -3.63
Q0143Q0143 SPC2Q04969 178 aa-7.65□□□□□ -3.63
Q0143Q0143 YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa-7.65□□□□□ -3.63
Q0143Q0143 SPP41P38904 1435 aa-7.66□□□□□ -3.64
Q0143Q0143 TLG1Q03322 224 aa-7.67□□□□□ -3.64
Q0143Q0143 RPO31P04051 1460 aa-7.68□□□□□ -3.64
Q0143Q0143 PDR11P40550 1411 aa-7.68□□□□□ -3.64
Q0143Q0143 YOR011W-AQ3E807 68 aa-7.69□□□□□ -3.64
Q0143Q0143 MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP-7.7□□□□□ -3.64
Q0143Q0143 SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP-7.71□□□□□ -3.64
Q0143Q0143 XRN1P22147 1528 aaKnown RBP-7.73□□□□□ -3.65
Q0143Q0143 RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP-7.74□□□□□ -3.65
Q0143Q0143 YOS1Q3E834 85 aa-7.75□□□□□ -3.65
Q0143Q0143 YCF1P39109 1515 aaKnown RBP-7.75□□□□□ -3.65
Q0143Q0143 MDS3P53094 1487 aa-7.75□□□□□ -3.65
Q0143Q0143 GNA1P43577 159 aaPredicted RBP-7.76□□□□□ -3.65
Q0143Q0143 YLR146W-AQ2V2P1 62 aa-7.77□□□□□ -3.65
Q0143Q0143 SWR1Q05471 1514 aa-7.78□□□□□ -3.65
Q0143Q0143 ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP-7.78□□□□□ -3.65
Q0143Q0143 NKP2Q06162 153 aa-7.78□□□□□ -3.65
Q0143Q0143 YBR230W-AQ3E762 66 aa-7.78□□□□□ -3.65
Q0143Q0143 NHP2P32495 156 aaPredicted RBP-7.81□□□□□ -3.66
Q0143Q0143 YBT1P32386 1661 aa-7.82□□□□□ -3.66
Q0143Q0143 YBL039W-BP0C268 59 aa-7.82□□□□□ -3.66
Q0143Q0143 FPR2P32472 135 aa-7.82□□□□□ -3.66
Q0143Q0143 YMR103CQ04436 120 aa-7.83□□□□□ -3.66
Q0143Q0143 YJL133C-AQ3E7A3 74 aa-7.83□□□□□ -3.66
Q0143Q0143 LHP1P33399 275 aaKnown RBP-7.84□□□□□ -3.66
Q0143Q0143 IQG1Q12280 1495 aa-7.87□□□□□ -3.67
Q0143Q0143 SNU13P39990 126 aaKnown RBP-7.88□□□□□ -3.67
Q0143Q0143 SWM2P40342 146 aa-7.88□□□□□ -3.67
Q0143Q0143 YLR099W-AQ3E798 87 aa-7.9□□□□□ -3.67
Q0143Q0143 RSM19P53733 91 aaPredicted RBP-7.91□□□□□ -3.68
Q0143Q0143 PDR5P33302 1511 aaKnown RBP-7.92□□□□□ -3.68
Q0143Q0143 YKL068W-AQ3E826 78 aa-7.94□□□□□ -3.68
Q0143Q0143 YKL065W-AQ2V2P2 73 aa-7.95□□□□□ -3.68
Q0143Q0143 ARO1P08566 1588 aaKnown RBP-7.96□□□□□ -3.68
Q0143Q0143 TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP-7.98□□□□□ -3.69
Q0143Q0143 YGL194C-AQ2V2P6 80 aa-8.03□□□□□ -3.69
Q0143Q0143 HIR3P47171 1648 aa-8.03□□□□□ -3.7
Q0143Q0143 STU1P38198 1513 aa-8.07□□□□□ -3.7
Q0143Q0143 RKR1Q04781 1562 aa-8.07□□□□□ -3.7
Q0143Q0143 HMRA1P0CY11 126 aa-8.11□□□□□ -3.71
Q0143Q0143 VMA7P39111 118 aa-8.11□□□□□ -3.71
Q0143Q0143 YGR121W-AQ3E816 71 aa-8.13□□□□□ -3.71
Q0143Q0143 PDR12Q02785 1511 aa-8.13□□□□□ -3.71
Q0143Q0143 PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP-8.13□□□□□ -3.71
Q0143Q0143 YLR157W-DP0CE99 70 aa-8.14□□□□□ -3.71
Q0143Q0143 NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP-8.14□□□□□ -3.71
Q0143Q0143 YDL022C-AP0C5L6 82 aa-8.15□□□□□ -3.71
Q0143Q0143 DOP1Q03921 1698 aa-8.15□□□□□ -3.71
Q0143Q0143 FYV7Q12247 151 aa-8.16□□□□□ -3.72
Q0143Q0143 NUP192P47054 1683 aa-8.18□□□□□ -3.72
Q0143Q0143 TSC11P40061 1430 aa-8.2□□□□□ -3.72
Q0143Q0143 DYN2Q02647 92 aa-8.21□□□□□ -3.72
Q0143Q0143 QCR6P00127 147 aa-8.22□□□□□ -3.73
Q0143Q0143 HUB1Q6Q546 73 aa-8.22□□□□□ -3.73
Q0143Q0143 YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP-8.24□□□□□ -3.73
Q0143Q0143 YGR035W-AQ45U48 73 aa-8.24□□□□□ -3.73
Q0143Q0143 WIP1Q2V2P8 89 aa-8.29□□□□□ -3.74
Q0143Q0143 RRT15Q3E811 62 aa-8.29□□□□□ -3.74
Q0143Q0143 NUP188P52593 1655 aaKnown RBP-8.3□□□□□ -3.74
Q0143Q0143 YOR314WQ12506 109 aa-8.31□□□□□ -3.74
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.7 ms