RNA–Protein interactions for RNA: YKR018C

YKR018C, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR018C, Length 2,178 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR018CYKR018C PBP4Q07362 185 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C YOR008C-AQ3E7B9 74 aa5.7□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C TRA1P38811 3744 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C YCL021W-AQ96VH3 125 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C ENV10Q99382 181 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C MRPS12P53732 153 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C MIC12P38341 106 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C SED1Q01589 338 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C ERF2Q06551 359 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C YCR085WP25650 117 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C URM1P40554 99 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C YDL009CQ12210 107 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C YOL085CQ99345 113 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C YHR139C-AO13536 103 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C YLR415CO13578 112 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C YDL186WP48568 277 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C NCE103P53615 221 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C COX12Q01519 83 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C CAX4P53223 239 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C INO2P26798 304 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C VMA11P32842 164 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C BNA1P47096 177 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR018CYKR018C RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C RPL16AP26784 199 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data5.65□□□□□ -1.51not detected
YKR018CYKR018C DCV1P43595 202 aa5.65□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C KNH1P50112 268 aa5.65□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YDR381C-AQ3E6R5 114 aa5.65□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YJR146WP47174 117 aa5.64□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YGR045CP53229 120 aa5.64□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C RPB10P22139 70 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C POR2P40478 281 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C AIM19P40502 157 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C COF1Q03048 143 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C LDB16P25587 256 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C SMP1P38128 452 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YGR219WP53307 113 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C CCW14O13547 238 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YBR200W-AQ3E755 54 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YIL059CP40520 121 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YNL046WP53956 172 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YDR029WQ12111 104 aa5.61□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C RPL15AP05748 204 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C PBA1Q05778 276 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YHL042WP38729 150 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YHL037CP38733 133 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YHR022CP38763 256 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YER121WP40076 114 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C TRP1P00912 224 aa5.59□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C YER039C-AP0CD97 72 aa5.59□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C PEX17P40155 199 aa5.59□□□□□ -1.51
YKR018CYKR018C RAD6P06104 172 aa5.59□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C IES6P32617 166 aa5.58□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C YPR117WQ06116 2489 aa5.58□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C ECM12O13529 151 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C YGL088WP53151 121 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C YML122CQ03207 126 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C YPL038W-AQ3E7B4 63 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C RPL16BP26785 198 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C SHU1P38751 150 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C KEG1P43614 200 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C HUR1P45820 110 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C YPR013CQ12145 317 aa5.56□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C YBR209WP38311 105 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C KRE9P39005 276 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C YLR042CQ07990 161 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C PPT2Q12036 173 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C YOR034C-AQ3E735 80 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C UBC5P15732 148 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C MSA2P36157 363 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C MPC2P38857 129 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C YEL008WP40001 126 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C RRT13P40042 185 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C CCW12Q12127 133 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C YOR011W-AQ3E807 68 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR018CYKR018C TOM6P33448 61 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR018CYKR018C SVP26P38869 228 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR018CYKR018C SHH4Q06236 168 aa5.52□□□□□ -1.53
YKR018CYKR018C SIM1P40472 476 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR018CYKR018C EMC6Q12431 108 aa5.51□□□□□ -1.53
YKR018CYKR018C QCR8P08525 94 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR018CYKR018C YFR035CP43608 114 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR018CYKR018C SUT1P53032 299 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
YKR018CYKR018C RGM1Q00453 211 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR018CYKR018C ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data5.5□□□□□ -1.53not detected
YKR018CYKR018C SBH2P52871 88 aa5.5□□□□□ -1.53
YKR018CYKR018C YSY6P38374 65 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR018CYKR018C YER135CP40082 130 aa5.49□□□□□ -1.53
YKR018CYKR018C YNL194CP40169 301 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58.5 ms