RNA–Protein interactions for RNA: YBR003W

COQ1, Transcript of Hexaprenyl pyrophosphate synthetase, yeast

Gene COQ1, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COQ1	YBR003W	YCR001W	P25347	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	DGA1	Q08650	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YCR007C	P25354	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	NRG2	P38082	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	KRE9	P39005	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	BET5	Q03630	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YKL070W	P36087	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YJR146W	P47174	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	PMP3	P87284	55 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YPT53	P36019	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YKL044W	P36092	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YBR209W	P38311	105 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	PAU23	Q07987	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	PAU17	Q12370	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	UBC5	P15732	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	AIM29	P36154	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YGL088W	P53151	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	TRP1	P00912	224 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	YIL059C	P40520	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	GLC8	P41818	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	VAM10	Q08474	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	YPL261C	Q08976	102 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.83	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	SGF11	Q03067	99 aa		4.82	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	ATP15	P21306	62 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	YPL073C	P40323	161 aa		4.81	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	HAP3	P13434	144 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	MRP49	P32388	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	YEL008W	P40001	126 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
COQ1	YBR003W	AIM11	P87275	137 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	SCW10	Q04951	389 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	YKR041W	P36134	250 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	CRC1	Q12289	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	AUA1	P32450	94 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	YER085C	P40058	173 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	HAL1	Q01766	294 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	MHR1	Q06630	226 aa		4.79	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	YEL067C	P39978	195 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	CWC27	Q02770	301 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.78	□□□□□ -1.64
COQ1	YBR003W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
COQ1	YBR003W	YNR077C	P53758	84 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.76	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	CIN5	P40917	295 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	YML079W	Q03629	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	SHU1	P38751	150 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	UIP3	P39547	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	OXA1	P39952	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
COQ1	YBR003W	PEX17	P40155	199 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	YFR057W	P43625	151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.74	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	YBR219C	P38317	127 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	YAR029W	P39549	74 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	ELC1	Q03071	99 aa		4.73	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	MRPS12	P53732	153 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	SPC1	P46965	94 aa		4.72	□□□□□ -1.65
COQ1	YBR003W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	ERG28	P40030	148 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	YNL190W	P53872	204 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	ENV10	Q99382	181 aa		4.71	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.7	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	QCR8	P08525	94 aa		4.7	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	UGX2	P32772	223 aa		4.7	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.7	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	PPT2	Q12036	173 aa		4.7	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.69	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	DIF1	O13577	133 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	PAI3	P01094	68 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	MID2	P36027	376 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	COX14	P39103	70 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	YER181C	P40097	107 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	PBA1	Q05778	276 aa		4.68	□□□□□ -1.66
COQ1	YBR003W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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