RNA–Protein interactions for RNA: YPR119W

CLB2, Transcript of B-type cyclin involved in cell cycle progression, yeast

Gene CLB2, Length 1,476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cellular bud .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLB2	YPR119W	YNR077C	P53758	84 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	MRPL19	P53875	158 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YEL067C	P39978	195 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YCH1	P42937	148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	ECO1	P43605	281 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YIP1	P53039	248 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	SUN4	P53616	420 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	ABF2	Q02486	183 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	RRG8	Q06109	277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	CDC26	P14724	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	MBB1	P39534	108 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	FIP1	P45976	327 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	GON7	P46984	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	ENV10	Q99382	181 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	VMA11	P32842	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YIL059C	P40520	121 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	TOS6	P48560	102 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	TIM22	Q12328	207 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	MIC12	P38341	106 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	DSE2	P38844	325 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	COX12	Q01519	83 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YLR415C	O13578	112 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YCR006C	P25350	157 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	MRPL39	P36533	70 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	NRG2	P38082	220 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YER084W	P40057	128 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	FCY1	Q12178	158 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLB2	YPR119W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	RRT1	P38192	103 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YER085C	P40058	173 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	SPI1	P40092	148 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	VHS2	P40463	436 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YFL051C	P43552	160 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	LCB3	P47013	409 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	SBH2	P52871	88 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	ECM12	O13529	151 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	Q0255	P03881	472 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	AGA1	P32323	725 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	MID2	P36027	376 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.7	□□□□□ -1.66	not detected
CLB2	YPR119W	CAX4	P53223	239 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	AIM11	P87275	137 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	RXT3	Q07458	294 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YKL097C	P34245	136 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YHL042W	P38729	150 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YER121W	P40076	114 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YIA6	P40556	373 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	VPS55	P47111	140 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	KNH1	P50112	268 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	IMP2	P46972	177 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	PIR5	P46999	287 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	FAB1	P34756	2278 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	CCW14	O13547	238 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	MTC6	P38849	526 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	GLO1	P50107	326 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	SIP18	P50263	79 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	AIM34	Q03673	198 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	MRP10	O75012	95 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	INO2	P26798	304 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	SMP1	P38128	452 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	YFL015C	P43578	164 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	RNH203	Q12338	110 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CLB2	YPR119W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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