RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	MBB1	P39534	108 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	YGR025W	P53216	100 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	DAD1	Q12248	94 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	SEC11	P15367	167 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	YBR144C	P34215	104 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	PET8	P38921	284 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	HAC1	P41546	238 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	YOL160W	Q08321	113 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	LCB3	P47013	409 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	YGL118C	P53132	145 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	GEP3	Q08622	556 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	SPI1	P40092	148 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	BRP1	P53194	125 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	CAX4	P53223	239 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	RRG8	Q06109	277 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	YPL162C	Q12042	273 aa		4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	YKR032W	P36127	104 aa		4.4	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.4	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.4	□□□□□ -1.7
AMD1	YML035C	MDM10	P18409	493 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	MPC2	P38857	129 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YGL230C	P53074	147 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YIP3	P53633	176 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	DPP1	Q05521	289 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	CNL1	Q06333	122 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	SLO1	Q3E784	85 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	PAU7	P39545	55 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	GTO3	Q04806	366 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	RTG1	P32607	177 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	MST28	P39552	234 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	MST27	P53176	234 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	CPT1	P17898	393 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.38	□□□□□ -1.71	not detected
AMD1	YML035C	CCW12	Q12127	133 aa		4.38	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	PAI3	P01094	68 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	ANB1	P19211	157 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YJR096W	P47137	282 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	ALG13	P53178	202 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YCR007C	P25354	239 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YHR022C	P38763	256 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	SIM1	P40472	476 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	PRM7	Q12459	698 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YOL085C	Q99345	113 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YNL198C	P40166	100 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YDR274C	P87283	123 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YMR244W	Q04018	355 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YPT53	P36019	220 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	ATG33	Q06485	197 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	ATP23	P53722	227 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	VPS71	Q03433	280 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	ISU2	Q12056	156 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	MRP49	P32388	137 aa		4.34	□□□□□ -1.71
AMD1	YML035C	YER135C	P40082	130 aa		4.34	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	DIA1	P54005	336 aa		4.34	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	CYC7	P00045	113 aa		4.33	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	VAR1	P02381	398 aa		4.33	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	TIM22	Q12328	207 aa		4.33	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YCR023C	P25351	611 aa		4.33	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	MIG3	P39943	394 aa		4.33	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YNL184C	P53876	108 aa		4.33	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	GPI19	Q04082	140 aa		4.33	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	DGA1	Q08650	418 aa		4.33	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	CDC43	P18898	376 aa		4.32	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	APS1	P35181	156 aa		4.32	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YMR103C	Q04436	120 aa		4.32	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YHR140W	P38842	239 aa		4.32	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	SCW10	Q04951	389 aa		4.32	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.31	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	BET5	Q03630	159 aa		4.31	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	AQY1	P0CD91	305 aa		4.31	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	YAR1	P46683	200 aa		4.31	□□□□□ -1.72
AMD1	YML035C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.31	□□□□□ -1.72

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