RNA–Protein interactions for RNA: YKR055W

RHO4, Transcript of Non-essential small GTPase, yeast

Gene RHO4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RHO4	YKR055W	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	QRI5	P32344	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	MCH4	Q08268	501 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	IES4	Q08561	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	GGC1	P38988	300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	RRT13	P40042	185 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	GAT4	P40569	121 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	VPS55	P47111	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	MST27	P53176	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	COX17	Q12287	69 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	SRX1	P36077	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
RHO4	YKR055W	BUD8	P41698	603 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	TIM18	Q08749	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	BET1	P22804	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	ECM15	P35195	104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	HAL1	Q01766	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	MIM1	Q08176	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	IMP1	P28627	190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	APS1	P35181	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	MIX14	Q04341	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	RLM1	Q12224	676 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	EMC6	Q12431	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	ERG2	P32352	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	MTC7	P32633	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	CSH1	P38287	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	PEX17	P40155	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	YGR269W	P40326	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	VHS2	P40463	436 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	CDC1	P40986	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	ATP23	P53722	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
RHO4	YKR055W	YIL163C	P40448	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	PIR5	P46999	287 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RHO4	YKR055W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	RPP1	P38786	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	YPI1	P43587	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	UBC13	P52490	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	YNL234W	P53857	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	ATP19	P81451	68 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	SWD3	P38123	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	YER187W	P40102	141 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	SIM1	P40472	476 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	NRM1	P53718	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	PIR1	Q03178	341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	IRC23	Q08416	157 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	DIF1	O13577	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	MRP10	O75012	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	FPR2	P32472	135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	YSY6	P38374	65 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	YIL029C	P40538	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	LST8	P41318	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	PGU1	P47180	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	ROX3	P25046	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	YEL073C	P39974	107 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHO4	YKR055W	YNL217W	P40152	326 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.3 ms