RNA–Protein interactions for RNA: YKR049C

FMP46, Transcript of Putative redox protein containing a thioredoxin fold, yeast

Gene FMP46, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FMP46	YKR049C	ELF1	P36053	145 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	DAD2	P36162	133 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YHR140W	P38842	239 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	RRT13	P40042	185 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	NSE4	P43124	402 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	GPI19	Q04082	140 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
FMP46	YKR049C	PAM17	P36147	197 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	SUR2	P38992	349 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	SGF11	Q03067	99 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	AIM34	Q03673	198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YCR001W	P25347	104 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	ZRT1	P32804	376 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		3.13	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	MRPL28	P36527	147 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YPS5	P53057	165 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	HAL1	Q01766	294 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	GTO3	Q04806	366 aa		3.12	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YCR023C	P25351	611 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YGR149W	P48236	432 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	SDS23	P53172	527 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YGR017W	P53210	297 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	TVP18	Q04767	167 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	TEM1	P38987	245 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	CYT2	Q00873	224 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	DXO1	Q06349	442 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YLR042C	Q07990	161 aa		3.1	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YKR032W	P36127	104 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	SDH8	P38345	138 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	KRE9	P39005	276 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	YNL217W	P40152	326 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	ARL3	Q02804	198 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.09	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
FMP46	YKR049C	PFY1	P07274	126 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	PET8	P38921	284 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	YGL118C	P53132	145 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	MGR2	Q02889	113 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	DGA1	Q08650	418 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	ATP16	Q12165	160 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	CRC1	Q12289	327 aa		3.08	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	SAL1	D6W196	494 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	UBC5	P15732	148 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	RPR2	P40571	144 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	DCV1	P43595	202 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	SPC1	P46965	94 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	GLO1	P50107	326 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	ATP23	P53722	227 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	PMP3	P87284	55 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	MED7	Q08278	222 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	MRP49	P32388	137 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	YER076C	P40049	302 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	TOS6	P48560	102 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.06	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	TRP1	P00912	224 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	AQY1	P0CD91	305 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	YPT53	P36019	220 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	YJR146W	P47174	117 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	YDR042C	Q03205	200 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	DPP1	Q05521	289 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.04	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		3.03	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
FMP46	YKR049C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92

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