RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C DYN2Q02647 92 aa1.46□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YMR007WQ03675 126 aa1.46□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YPR098CQ06089 161 aa1.46□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C IRC19Q07843 230 aa1.46□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C COA2Q3E823 68 aa1.46□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YOS1Q3E834 85 aa1.46□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C HTL1Q9URQ5 78 aa1.46□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C MBF1O14467 151 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C Q0255P03881 472 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C CDC36P06100 191 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C RAD6P06104 172 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C TIR1P10863 254 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C SEC11P15367 167 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C HSP12P22943 109 aaKnown RBP1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C APS1P35181 156 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YHR125WP38831 101 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YNL198CP40166 100 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C MOB1P40484 314 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C MIC27P50945 234 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C MPP6P53725 186 aaPredicted RBP1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YDR209CQ03480 137 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C LPP1Q04396 274 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YOR186WQ08560 144 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C FIT3Q08907 204 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YIL102C-AQ2V2P5 75 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YCR075W-AQ3E830 75 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C HUG1Q6Q5K6 68 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YLR365WQ7LIF2 110 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C ATG40Q99325 256 aa1.45□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YDR157WA0A023PZE8 133 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C HMRA1P0CY11 126 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C RPL30P14120 105 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C NHP2P32495 156 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YKL102CP34249 101 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YUH1P35127 236 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C MSA2P36157 363 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C ECM33P38248 429 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C FYV4P38783 130 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C PAU7P39545 55 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C CUP9P41817 306 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YFL065CP43539 102 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YJR015WP47090 510 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YGR050CP53231 118 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C POP3P53833 195 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YLR460CP54007 376 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C NCE101Q02820 53 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YDR102CQ03864 110 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C SDH7Q04401 133 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C HPA2Q06592 156 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YPR203WQ08994 102 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C MCP1Q12106 302 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C USB1Q12208 290 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C ATO3Q12359 275 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YDR524C-BQ3E6R4 66 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa1.44□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YCR023CP25351 611 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C SRP21P32342 167 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C UGX2P32772 223 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C RPB7P34087 171 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C MRPL39P36533 70 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C SRP14P38985 146 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YER181CP40097 107 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C CCS1P40202 249 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YPL073CP40323 161 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YGR269WP40326 108 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YGR039WP53225 103 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C ABF2Q02486 183 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C VPS71Q03433 280 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C SPG4Q04438 115 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C POC4Q12245 148 aaPredicted RBP1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C MPD1Q12404 318 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YOR343CQ12484 108 aa1.43□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YKL044WP36092 106 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YBR090CP38253 122 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YHR173CP38864 112 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C CTR2P38865 189 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YNL200CP40165 246 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C TOM7P53507 60 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C ATP19P81451 68 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C UBC7Q02159 165 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C RAV2Q03956 351 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YHP1Q04116 353 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C DAD1Q12248 94 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YDL180WQ12301 547 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YOR192C-CQ3E736 78 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YIR021W-AQ3E739 70 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YHR214C-EQ8TGK0 99 aa1.42□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C HSP150P32478 413 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C MRPL24P36525 258 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C SFT2P38166 215 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C YAR068WP39564 161 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C HUA1P40325 198 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C CWP2P43497 92 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C DAD4P69851 72 aa1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C COF1Q03048 143 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
CSE4YKL049C MRPS8Q03799 155 aa1.41□□□□□ -2.18
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