RNA–Protein interactions for RNA: YDR062W

LCB2, Transcript of Component of serine palmitoyltransferase, yeast

Gene LCB2, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCB2	YDR062W	YML079W	Q03629	201 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	YHP1	Q04116	353 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	SAE3	P89114	91 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	CYT2	Q00873	224 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	TMA23	Q03525	211 aa		3.42	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	SPS2	P08459	502 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	YCR050C	P25630	102 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	ETR1	P38071	380 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	YEL067C	P39978	195 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	YDL241W	Q07738	123 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	UBR1	P19812	1950 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	COX8	P04039	78 aa		3.4	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	NMT1	P14743	455 aa		3.4	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		3.4	□□□□□ -1.86
LCB2	YDR062W	YPR096C	O13587	100 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	SFT2	P38166	215 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	YGR269W	P40326	108 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	FLX1	P40464	311 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	HFA1	P32874	2273 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	GAT4	P40569	121 aa		3.39	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	MPM1	P40364	252 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	FYV7	Q12247	151 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	PRM7	Q12459	698 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	YDL012C	Q12489	107 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	HUT1	Q12520	339 aa		3.38	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	AIM18	P38884	321 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	RPB11	P38902	120 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	IRA1	P18963	3092 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	YHL042W	P38729	150 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	YAL064W	P39711	94 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	DIE2	P50076	525 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	SWC7	Q06707	132 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	FIT2	Q08906	153 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	KTI11	Q3E840	82 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	STF2	P16965	84 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.36	□□□□□ -1.87	not detected
LCB2	YDR062W	MIX17	Q03667	156 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	IRC19	Q07843	230 aa		3.36	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	MDM35	O60200	86 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	ANB1	P19211	157 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	DSE2	P38844	325 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	KEI1	Q06346	221 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	YLR042C	Q07990	161 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	YOR385W	Q08909	290 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	OCA6	Q12454	224 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	YDL157C	Q12082	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
LCB2	YDR062W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	YCR101C	P25607	182 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	GTT2	Q12390	233 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	UTR5	P32630	166 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	SOM1	Q05676	74 aa		3.33	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	CSF1	Q12150	2958 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	COX5B	P00425	151 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	YMR252C	Q04814	134 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	ELP6	Q04868	273 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	RAF1	Q06891	181 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	HRT1	Q08273	121 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	MEC1	P38111	2368 aa		3.32	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	STT4	P37297	1900 aa		3.31	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	FYV5	P25585	152 aa		3.3	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		3.3	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	YKR045C	P36138	183 aa		3.3	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	YGL230C	P53074	147 aa		3.3	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		3.3	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	CWC27	Q02770	301 aa		3.29	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	RPL43B	P0CX26	92 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	MRPL15	P36523	253 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	QCR10	P37299	77 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	YAR029W	P39549	74 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	HPA3	P39979	161 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	RTR2	Q12378	196 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LCB2	YDR062W	DAN1	P47178	298 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LCB2	YDR062W	YPR153W	Q06537	140 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LCB2	YDR062W	MRPL44	P19956	98 aa		3.26	□□□□□ -1.89
LCB2	YDR062W	RPB7	P34087	171 aa		3.26	□□□□□ -1.89
LCB2	YDR062W	SRL3	P36167	246 aa		3.26	□□□□□ -1.89
LCB2	YDR062W	MET31	Q03081	177 aa		3.26	□□□□□ -1.89

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