RNA–Protein interactions for RNA: YBR003W

COQ1, Transcript of Hexaprenyl pyrophosphate synthetase, yeast

Gene COQ1, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COQ1	YBR003W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	AGE2	P40529	298 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	MIC26	P50087	233 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	YMR244W	Q04018	355 aa		5.04	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	VMA16	P23968	213 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	YBR144C	P34215	104 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	TEM1	P38987	245 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	ALG13	P53178	202 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	BRP1	P53194	125 aa		5.03	□□□□□ -1.6
COQ1	YBR003W	YKR032W	P36127	104 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	MPC2	P38857	129 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	MIG3	P39943	394 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	KEG1	P43614	200 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	ERV14	P53173	138 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	MRPS8	Q03799	155 aa		5.02	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	VAR1	P02381	398 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	YKL102C	P34249	101 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	PET8	P38921	284 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	YJL028W	P47062	111 aa		5.01	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		5	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	FUN14	P18411	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	PAU16	P35994	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	TVP18	Q04767	167 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	Q0255	P03881	472 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	YFR035C	P43608	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	SCM4	P32564	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	ELF1	P36053	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	YDR274C	P87283	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	YDR366C	P87287	132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	CNL1	Q06333	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	MIG1	P27705	504 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	YER076C	P40049	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	ATP23	P53722	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	DPP1	Q05521	289 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COQ1	YBR003W	SAL1	D6W196	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	MRPL44	P19956	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	YCR023C	P25351	611 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	MGR2	Q02889	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	MSC3	Q05812	728 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	PFY1	P07274	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	AIM34	Q03673	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	FYV7	Q12247	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	RRT13	P40042	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	PCL2	P25693	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	VHS2	P40463	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	HAC1	P41546	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	GLO1	P50107	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	NAT5	Q08689	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	SEC11	P15367	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	YCH1	P42937	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	DCV1	P43595	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	APS1	P35181	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	TOS6	P48560	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	YGL230C	P53074	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	COX12	Q01519	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	ATP5	P09457	212 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	HMRA2	P0CY13	119 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	VPS71	Q03433	280 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COQ1	YBR003W	YNL217W	P40152	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YPS5	P53057	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	SAE3	P89114	91 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COQ1	YBR003W	DYN1	P36022	4092 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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