RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W CCW14O13547 238 aa7.32□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W GEP3Q08622 556 aa7.32□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W YLR342W-AQ3E810 57 aa7.32□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W LSM8P47093 109 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W CGR1P53188 120 aa7.31□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W SEN15Q04675 128 aa7.31□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W ATG39Q06159 398 aa7.31□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W YPR013CQ12145 317 aa7.31□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W YDR215CQ12240 137 aa7.31□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W TDA4P47153 279 aa7.3□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W OST3P48439 350 aa7.3□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W PRM3Q08931 133 aa7.3□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W COA6Q3E846 104 aa7.3□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W YER190C-BP0CX94 160 aa7.29□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W YEL077W-AP0CX95 160 aa7.29□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W YGR296C-BP0CX96 160 aa7.29□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W YPL283W-BP0CX97 160 aa7.29□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W YPR204C-AP0CX98 160 aa7.29□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W PAU7P39545 55 aa7.29□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W SDS23P53172 527 aa7.29□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W YGR025WP53216 100 aa7.29□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W UPS3Q04006 179 aa7.29□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W CSM4Q08955 156 aa7.29□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W POM33Q12164 279 aa7.29□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W NUM1Q00402 2748 aa7.28□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W SEC4P07560 215 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W RPL12AP0CX53 165 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W RPL12BP0CX54 165 aa7.28□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W CPT1P17898 393 aa7.28□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W MDM10P18409 493 aa7.28□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W ZRT1P32804 376 aa7.28□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W SPI1P40092 148 aa7.28□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W PRE5P40302 234 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W FIP1P45976 327 aa7.28□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W IZH3Q07959 543 aa7.28□□□□□ -1.24
BRR1YPR057W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W RPA43P46669 326 aa7.27□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W CAX4P53223 239 aa7.27□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W YIL134C-AQ45U18 67 aa7.27□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W MST28P39552 234 aa7.26□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W MST27P53176 234 aa7.26□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W THG1P53215 237 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W DUG3P53871 357 aa7.26□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W COX16P47081 118 aa7.25□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W YIP3P53633 176 aa7.25□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W TIM22Q12328 207 aa7.25□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa7.25□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W GTO3Q04806 366 aa7.24□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W RRG8Q06109 277 aa7.24□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W PRM7Q12459 698 aa7.24□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W YOR011W-AQ3E807 68 aa7.24□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W VMA16P23968 213 aa7.23□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W YER134CP40081 178 aa7.23□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W YGL118CP53132 145 aa7.23□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W ERV14P53173 138 aa7.23□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W YPL162CQ12042 273 aa7.23□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W CCW12Q12127 133 aa7.23□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W WIP1Q2V2P8 89 aa7.23□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W GSP1P32835 219 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W GSP2P32836 220 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W YHR022CP38763 256 aa7.22□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W TEM1P38987 245 aa7.22□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W SEC72P39742 193 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W YJR096WP47137 282 aa7.22□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W BRP1P53194 125 aa7.22□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W GPI19Q04082 140 aa7.22□□□□□ -1.25
BRR1YPR057W YKL102CP34249 101 aa7.21□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W PRY2P36110 329 aa7.21□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YHR140WP38842 239 aa7.21□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YGR017WP53210 297 aa7.21□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YHR212W-AP0CX91 67 aa7.2□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YFL068WP0CX99 160 aa7.2□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YLL066W-AP0CY00 160 aa7.2□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YLL067W-AP0CY01 160 aa7.2□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YER135CP40082 130 aa7.2□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W SIM1P40472 476 aa7.2□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YDL186WP48568 277 aa7.2□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W DIA1P54005 336 aa7.2□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W MSA1Q08471 629 aa7.2□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W PAU16P35994 123 aa7.19□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YJL028WP47062 111 aa7.19□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W TAR1Q8TGM6 124 aa7.19□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W FUN14P18411 198 aa7.18□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W UTR5P32630 166 aa7.18□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W YOL085CQ99345 113 aa7.18□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W VAR1P02381 398 aa7.17□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W AGA1P32323 725 aa7.17□□□□□ -1.26
BRR1YPR057W SCM4P32564 187 aa7.17□□□□□ -1.26
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