RNA–Protein interactions for RNA: YMR314W

PRE5, Transcript of Alpha 6 subunit of the 20S proteasome, yeast

Gene PRE5, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRE5	YMR314W	SPO13	P23624	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRE5	YMR314W	AME1	P38313	324 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PRE5	YMR314W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRE5	YMR314W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PRE5	YMR314W	YCR023C	P25351	611 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	MET32	Q12041	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	YHR173C	P38864	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	CAF40	P53829	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	RAV2	Q03956	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	TRS20	P38334	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	HUA1	P40325	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	MMS2	P53152	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	YNR066C	P53752	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	DAD1	Q12248	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	TIM21	P53220	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	DAD4	P69851	72 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	YMR320W	Q04897	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	SUR2	P38992	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	YIL059C	P40520	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	YGL185C	P53100	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	UBC5	P15732	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	POG1	P40473	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	PMP3	P87284	55 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	TIM22	Q12328	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	YDR010C	Q12426	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PRE5	YMR314W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	SEC59	P20048	519 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	HMX1	P32339	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	YPT10	P38146	199 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	TEM1	P38987	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	DIA1	P54005	336 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	UPS3	Q04006	179 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	MIX23	P38162	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	YGL117W	P53133	265 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	ATG33	Q06485	197 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	YBR292C	P38357	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	ACB1	P31787	87 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	ERG28	P40030	148 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
PRE5	YMR314W	POF1	P25576	258 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	YGR026W	P53217	278 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	MHR1	Q06630	226 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PRE5	YMR314W	MRP49	P32388	137 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	YFR045W	P43617	309 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	SNA2	P56508	79 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	TIR1	P10863	254 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	SMP1	P38128	452 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	AIM19	P40502	157 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	ATP19	P81451	68 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	PGD1	P40356	397 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	YIL163C	P40448	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	DXO1	Q06349	442 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	ANT1	Q06497	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	CYB5	P40312	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	SRB7	P47822	140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	CIN5	P40917	295 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	TAD2	P47058	250 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	ADD37	Q03233	198 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PRE5	YMR314W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PRE5	YMR314W	FZF1	P32805	299 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRE5	YMR314W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PRE5	YMR314W	PAU4	P53427	120 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PRE5	YMR314W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRE5	YMR314W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRE5	YMR314W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PRE5	YMR314W	YAL064W	P39711	94 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRE5	YMR314W	RPC10	P40422	70 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PRE5	YMR314W	YHR140W	P38842	239 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRE5	YMR314W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PRE5	YMR314W	MOG1	P47123	218 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PRE5	YMR314W	PEX22	P39718	180 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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