RNA–Protein interactions for RNA: YHR036W

BRL1, Transcript of Essential nuclear envelope integral membrane protein, yeast

Gene BRL1, Length 1,416 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRL1	YHR036W	MSK1	P32048	576 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	RRT1	P38192	103 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	YEA6	P39953	335 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	PAU15	P40585	124 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	MIC26	P50087	233 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	CYC3	P06182	269 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	FMT1	P32785	401 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	NIF3	P53081	288 aa		4.14	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	CUP2	P15315	225 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	AGA2	P32781	87 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YAR068W	P39564	161 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	DAD3	P69850	94 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	SGF11	Q03067	99 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	AVO2	Q04749	426 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	PAM18	Q07914	168 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	PAU23	Q07987	124 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	PAU17	Q12370	124 aa		4.13	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	PAI3	P01094	68 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	SNF11	P38956	169 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	SRP14	P38985	146 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	ERG28	P40030	148 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	ANB1	P19211	157 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YBL071C	P38185	102 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	OXA1	P39952	402 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	EMC5	P40540	141 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	RPR2	P40571	144 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	APS2	Q00381	147 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	POS5	Q06892	414 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	ATG41	Q12048	136 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YCT1	Q12235	531 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	RDI1	Q12434	202 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.12	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	VAR1	P02381	398 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	POP5	P28005	173 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	TRS20	P38334	175 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YHR130C	P38834	111 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YJR015W	P47090	510 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YGR149W	P48236	432 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	MGA1	P53050	456 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	LST7	P53237	242 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	TMA23	Q03525	211 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	CTR3	Q06686	241 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	LDS2	Q08218	356 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	PUT1	P09368	476 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	PAU3	P25610	124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	TIR2	P33890	251 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	TIM18	Q08749	192 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	TOA2	P32774	122 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	CMC1	P36064	111 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YKL070W	P36087	169 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	HIT1	P46973	164 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	AIM25	P47140	327 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	EST3	Q03096	181 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BRL1	YHR036W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	DFG10	P40526	253 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	CAT5	P41735	233 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	BNS1	P50084	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	UBC7	Q02159	165 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	IZH1	Q03419	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	KEI1	Q06346	221 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	VAM10	Q08474	114 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	INO4	P13902	151 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	MRP49	P32388	137 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	YER076C	P40049	302 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	GPI2	P46961	280 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	THI74	Q04083	370 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	YDL157C	Q12082	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	ERV2	Q12284	196 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BRL1	YHR036W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76

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