RNA–Protein interactions for RNA: YER141W

COX15, Transcript of Protein required for the hydroxylation of heme O to form heme A, yeast

Gene COX15, Length 1,461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COX15	YER141W	YMR141C	P40211	102 aa		5	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	VHS2	P40463	436 aa		5	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	COX19	Q3E731	98 aa		5	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	MRPL4	P36517	319 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	YIL163C	P40448	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	RPR2	P40571	144 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.99	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	COQ3	P27680	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	MSK1	P32048	576 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	YPT10	P38146	199 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	AME1	P38313	324 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.98	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	CYB5	P40312	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	YPS5	P53057	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	DIA1	P54005	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	SNO1	Q03144	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX15	YER141W	VAR1	P02381	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	COX16	P47081	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	ECM25	P32525	599 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	SNN1	P48232	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	COA4	Q05809	96 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	CRC1	Q12289	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	POG1	P40473	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YDL183C	P48569	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YGR017W	P53210	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YDR366C	P87287	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	UPS3	Q04006	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	NAT3	Q06504	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	SPI1	P40092	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YFR045W	P43617	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	DAD3	P69850	94 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	PCC1	Q3E833	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	POF1	P25576	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	VMA7	P39111	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YCH1	P42937	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	SPC1	P46965	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	HIT1	P46973	164 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YGL185C	P53100	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	CSM4	Q08955	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	TIM22	Q12328	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	MRPL28	P36527	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YNL217W	P40152	326 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	TIM21	P53220	239 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	FMP16	Q12497	93 aa		4.92	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	AGA1	P32323	725 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YPT53	P36019	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	IRC22	P40006	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	RRT13	P40042	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	ATP19	P81451	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	AIM34	Q03673	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	ANB1	P19211	157 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	SEC59	P20048	519 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	ELF1	P36053	145 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	SUR2	P38992	349 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	GAT4	P40569	121 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	UBC12	P52491	188 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	MGA1	P53050	456 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	DXO1	Q06349	442 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	DCN1	Q12395	269 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.9	□□□□□ -1.62
COX15	YER141W	YBR090C	P38253	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	BRP1	P53194	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
COX15	YER141W	SRB6	P32570	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	FZF1	P32805	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	RPB11	P38902	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	TEM1	P38987	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	YGR026W	P53217	278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	DGA1	Q08650	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
COX15	YER141W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	MIX23	P38162	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	SVP26	P38869	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	KRE9	P39005	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	PGD1	P40356	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	ATP23	P53722	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	GIM5	Q04493	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	PBA1	Q05778	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	YPR195C	Q06594	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	TIR1	P10863	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COX15	YER141W	YHR140W	P38842	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 63 ms