RNA–Protein interactions for RNA: YDR077W

SED1, Transcript of Major stress-induced structural GPI-cell wall glycoprotein, yeast

Gene SED1, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SED1	YDR077W	MED7	Q08278	222 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	YOL160W	Q08321	113 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	PAU7	P39545	55 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	RRG8	Q06109	277 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	ATG39	Q06159	398 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	LCB3	P47013	409 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	YDL186W	P48568	277 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	DUG3	P53871	357 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	UPS3	Q04006	179 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	CSM4	Q08955	156 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	MET32	Q12041	191 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	CAX4	P53223	239 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	YPL162C	Q12042	273 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	YPR063C	Q12160	140 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	POM33	Q12164	279 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	TMA17	Q12513	150 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	MST28	P39552	234 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	FIP1	P45976	327 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	COX16	P47081	118 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	TDA4	P47153	279 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	SDS23	P53172	527 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	MST27	P53176	234 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	CGR1	P53188	120 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	YPR013C	Q12145	317 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SED1	YDR077W	CPT1	P17898	393 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	GTO3	Q04806	366 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YDR215C	Q12240	137 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	PRY2	P36110	329 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	RPA43	P46669	326 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YIP3	P53633	176 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	ATG33	Q06485	197 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	COA6	Q3E846	104 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	RPL12B	P0CX54	165 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	ZRT1	P32804	376 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YGR025W	P53216	100 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	SEN15	Q04675	128 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	MDM10	P18409	493 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	SPI1	P40092	148 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	OST3	P48439	350 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YGR017W	P53210	297 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	MSA1	Q08471	629 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	PRM7	Q12459	698 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	VMA16	P23968	213 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YGL118C	P53132	145 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	CCW12	Q12127	133 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	TIM22	Q12328	207 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YFL068W	P0CX99	160 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YHR022C	P38763	256 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	YJR096W	P47137	282 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	GPI19	Q04082	140 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SED1	YDR077W	UTR5	P32630	166 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	DIA1	P54005	336 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	YHR140W	P38842	239 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	SIM1	P40472	476 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	YBR144C	P34215	104 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	YER134C	P40081	178 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	ALG13	P53178	202 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	MSN1	P22148	382 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	TEM1	P38987	245 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	YER135C	P40082	130 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	KEG1	P43614	200 aa		7.3	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
SED1	YDR077W	YMR244W	Q04018	355 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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