RNA–Protein interactions for RNA: YDL193W

NUS1, Transcript of Putative prenyltransferase, yeast

Gene NUS1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUS1	YDL193W	GEP7	P53171	287 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	RCE1	Q03530	315 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	KEI1	Q06346	221 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	DGA1	Q08650	418 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YPL264C	Q08980	353 aa		3.19	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	MSW1	P04803	379 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	SPO13	P23624	291 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	SDH4	P37298	181 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	GPI2	P46961	280 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YPL039W	Q03080	316 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	GAS3	Q03655	524 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	MYO1	P08964	1928 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	APS1	P35181	156 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YHR140W	P38842	239 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	AVT2	P39981	480 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	PEX17	P40155	199 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	PET191	Q02772	108 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YMR103C	Q04436	120 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	CSI2	Q08054	341 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YOL131W	Q08270	108 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	IES4	Q08561	116 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YDR029W	Q12111	104 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	TIM22	Q12328	207 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YOS1	Q3E834	85 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	MOT1	P32333	1867 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	VMA11	P32842	164 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YBR032W	P38223	100 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YAR029W	P39549	74 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YFL065C	P43539	102 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YGR164W	P53291	111 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	PGA1	P53896	198 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	EMI1	Q04406	187 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	FIT1	Q04433	528 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	FIT3	Q08907	204 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YPR203W	Q08994	102 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	YPL162C	Q12042	273 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	TSC3	Q3E790	80 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	TRA1	P38811	3744 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NUS1	YDL193W	ECM12	O13529	151 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YBR063C	P38083	404 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YGL034C	P53186	121 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.15	□□□□□ -1.91	not detected
NUS1	YDL193W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YMR082C	Q04276	118 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	PAU23	Q07987	124 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YPR011C	Q12251	326 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YDL180W	Q12301	547 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	PAU17	Q12370	124 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YPL247C	Q12523	523 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YLR422W	Q06409	1932 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	MIG1	P27705	504 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
NUS1	YDL193W	YER181C	P40097	107 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	CUP9	P41817	306 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	FIP1	P45976	327 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	TDA4	P47153	279 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	BUD25	P85052	153 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	CYT2	Q00873	224 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YGL010W	P25338	174 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	UTR5	P32630	166 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	CSH1	P38287	376 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	CWP2	P43497	92 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	ECO1	P43605	281 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	ERV29	P53337	310 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	RAF1	Q06891	181 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YOL160W	Q08321	113 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	PRM3	Q08931	133 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	MSB2	P32334	1306 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	SFT2	P38166	215 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	NAT5	Q08689	176 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NUS1	YDL193W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		3.12	□□□□□ -1.91

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