RNA–Protein interactions for RNA: YOR142W

LSC1, Transcript of Alpha subunit of succinyl-CoA ligase, yeast

Gene LSC1, Length 990 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LSC1	YOR142W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	CAF40	P53829	373 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	YER135C	P40082	130 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	TOM7	P53507	60 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	FMP16	Q12497	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	MIG3	P39943	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	SPC25	P40014	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	COX12	Q01519	83 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	MRX11	Q03079	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	RAV2	Q03956	351 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSC1	YOR142W	ZRC1	P20107	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	PHD1	P36093	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YFR035C	P43608	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	SNX4	P47057	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	PAU4	P53427	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	TMA23	Q03525	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	GEP3	Q08622	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	ATX2	Q12067	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	NNK1	P36003	928 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	ATP14	Q12349	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	MRS1	P07266	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YHR022C	P38763	256 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YHR173C	P38864	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YMR141C	P40211	102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	SNN1	P48232	102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	LOA1	Q06508	300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YPL162C	Q12042	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	ERV2	Q12284	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	HTB2	P02294	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	MSK1	P32048	576 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	ACP1	P32463	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	PAU13	P38725	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	VMA7	P39111	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YIL163C	P40448	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	UBC12	P52491	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	PAU10	Q03050	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	PAU20	Q08322	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	CCW12	Q12127	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YLR302C	O13544	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	HMX1	P32339	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	SHG1	P38337	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	SPI1	P40092	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	STP4	Q07351	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	RIB5	P38145	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	MCM22	P47167	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LSC1	YOR142W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	YBR090C	P38253	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	YJR096W	P47137	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	CYC7	P00045	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	YCR001W	P25347	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	AFR1	P33304	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	DAD4	P69851	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	VAR1	P02381	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	CPT1	P17898	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	COQ3	P27680	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	FZF1	P32805	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	AME1	P38313	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	VHS2	P40463	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	HIT1	P46973	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	YKL069W	P36088	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	YPT10	P38146	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	CYB5	P40312	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	SRP14	P38985	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LSC1	YOR142W	PGD1	P40356	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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