RNA–Protein interactions for RNA: YOR063W

RPL3, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L3, yeast

Gene RPL3, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL3	YOR063W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	AIM29	P36154	155 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YGR269W	P40326	108 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	POG1	P40473	351 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YNL046W	P53956	172 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	DYN2	Q02647	92 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YPD1	Q07688	167 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PPT2	Q12036	173 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YCL048W-A	Q2V2Q2	79 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	SPS18	P32572	300 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
RPL3	YOR063W	PGD1	P40356	397 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YIL012W	P40551	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	VMA21	P41806	77 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YFR057W	P43625	151 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	HHO1	P53551	258 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YMR007W	Q03675	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	AVO2	Q04749	426 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	CTR3	Q06686	241 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	MSA1	Q08471	629 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	INO2	P26798	304 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	IES6	P32617	166 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YBL059W	P34224	193 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	NSE4	P43124	402 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	HIT1	P46973	164 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YJR015W	P47090	510 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	BNS1	P50084	137 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YGR026W	P53217	278 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PAU4	P53427	120 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YNR064C	P53750	290 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PBA1	Q05778	276 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	ATP16	Q12165	160 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YPS3	Q12303	508 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	QCR9	P22289	66 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	POF1	P25576	258 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	RPB9	P27999	122 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PAU13	P38725	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PEX22	P39718	180 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	MOG1	P47123	218 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PAU10	Q03050	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YHP1	Q04116	353 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PAU20	Q08322	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	ERV2	Q12284	196 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	JID1	Q12350	301 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	SDH4	P37298	181 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	DER1	P38307	211 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	PHS1	P40857	217 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	DAN1	P47178	298 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	BOR1	P53838	576 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	SHH3	Q04487	196 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	IRC25	Q07951	179 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	SEC59	P20048	519 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YKR045C	P36138	183 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	GPI18	P38211	433 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	YER188W	P40103	239 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	GTT1	P40582	234 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	SBH2	P52871	88 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	MIX17	Q03667	156 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	ATO3	Q12359	275 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RPL3	YOR063W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPL3	YOR063W	APA2	P22108	325 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RPL3	YOR063W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPL3	YOR063W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPL3	YOR063W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RPL3	YOR063W	MRPS9	P38120	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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