RNA–Protein interactions for RNA: YMR236W

TAF9, Transcript of Subunit (17 kDa) of TFIID and SAGA complexes, yeast

Gene TAF9, Length 474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TAF9	YMR236W	YER135C	P40082	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	ATX2	Q12067	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	MBB1	P39534	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	SNX4	P47057	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	FIT2	Q08906	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	CCW12	Q12127	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	ERV2	Q12284	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	MRS1	P07266	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	AFR1	P33304	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	MIG3	P39943	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	SPC25	P40014	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	EMC5	P40540	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	YJR096W	P47137	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	DSK2	P48510	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	GNP1	P48813	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	YGR025W	P53216	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	ADD37	Q03233	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	SGF11	Q03067	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	VAM10	Q08474	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	TRS20	P38334	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	YHR022C	P38763	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	YHR173C	P38864	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	HAL1	Q01766	294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	PLP1	Q04004	230 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TAF9	YMR236W	CPT1	P17898	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	HMX1	P32339	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	PHO23	P50947	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	PAU4	P53427	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	TMA23	Q03525	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	COX19	Q3E731	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	HTB2	P02294	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	NNK1	P36003	928 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	SOH1	P38633	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	PAU13	P38725	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	PAU10	Q03050	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	PAU20	Q08322	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	YCR001W	P25347	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	AME1	P38313	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	SPI1	P40092	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	TOM7	P53507	60 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	VAR1	P02381	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	VMA16	P23968	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	YKL069W	P36088	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	RIB5	P38145	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	CYB5	P40312	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	VHS2	P40463	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	KEG1	P43614	200 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	COX16	P47081	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	SNO1	Q03144	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	RAV2	Q03956	351 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	MSK1	P32048	576 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	YPT10	P38146	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	YGL185C	P53100	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	DAD1	Q12248	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	MRPL4	P36517	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	YCH1	P42937	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	DAD4	P69851	72 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	YDR366C	P87287	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TAF9	YMR236W	ECM25	P32525	599 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TAF9	YMR236W	UBC12	P52491	188 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TAF9	YMR236W	TIM21	P53220	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TAF9	YMR236W	ATP19	P81451	68 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TAF9	YMR236W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TAF9	YMR236W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TAF9	YMR236W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 88.8 ms