RNA–Protein interactions for RNA: YKR029C

SET3, Transcript of Defining member of the SET3 histone deacetylase complex, yeast

Gene SET3, Length 2,256 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET3	YKR029C	FLX1	P40464	311 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YFL019C	P43576	117 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	DAD4	P69851	72 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	NAT3	Q06504	195 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YPR013C	Q12145	317 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	PEX11	Q12462	236 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	RAD50	P12753	1312 aa		0.63	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	ARO7	P32178	256 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YKL102C	P34249	101 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	FMP23	P38231	175 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	NVJ1	P38881	321 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	TIM13	P53299	105 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YNL033W	P53964	284 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	UBC7	Q02159	165 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	CWC27	Q02770	301 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	GPI17	Q04080	534 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	PHO85	P17157	305 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	STP22	P25604	385 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	XPT1	P47165	209 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	SBH1	P52870	82 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YLR460C	P54007	376 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	VPS28	Q02767	242 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YOR015W	Q12169	119 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	DGK1	Q12382	290 aa		0.62	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	COX8	P04039	78 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YCR023C	P25351	611 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	RAD51	P25454	400 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	CLG1	P35190	452 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YHL042W	P38729	150 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	HPA3	P39979	161 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	SOK1	P40317	901 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	RFC2	P40348	353 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	PIR1	Q03178	341 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	UPS3	Q04006	179 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YPR127W	Q06494	345 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	DAS2	Q12084	232 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	HSP30	P25619	332 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	NUF2	P33895	451 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YKR041W	P36134	250 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YIP3	P53633	176 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	GIM5	Q04493	163 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YLR046C	Q12253	270 aa		0.61	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	RPB7	P34087	171 aa		0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	HHT1	P61830	136 aa		0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YKR005C	Q02203	525 aa		0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	GAL83	Q04739	417 aa		0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	RNH202	Q05635	350 aa		0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	FIT2	Q08906	153 aa		0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	GRE1	Q08969	168 aa		0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	ATP20	Q12233	115 aa		0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YOR214C	Q12282	236 aa		0.6	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	CCW14	O13547	238 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	VAR1	P02381	398 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	RAD6	P06104	172 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	RRT1	P38192	103 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	TTI2	P47168	421 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	SBH2	P52871	88 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	MAK3	Q03503	176 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YMR007W	Q03675	126 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	HRD1	Q08109	551 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		0.59	□□□□□ -2.31
SET3	YKR029C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	STF2	P16965	84 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YFL065C	P43539	102 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YNL140C	P53910	189 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	TLG1	Q03322	224 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YDR476C	Q03362	224 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	FYV12	Q08559	129 aa		0.59	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.58	□□□□□ -2.32	not detected
SET3	YKR029C	MET31	Q03081	177 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	DML1	Q03652	475 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YMR252C	Q04814	134 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YLR053C	Q12026	108 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	QCR2	P07257	368 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	SEN2	P16658	377 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YBL010C	P32788	280 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YIL086C	P40503	102 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	NSE4	P43124	402 aa		0.58	□□□□□ -2.32
SET3	YKR029C	YHP1	Q04116	353 aa		0.58	□□□□□ -2.32

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