RNA–Protein interactions for RNA: YHR036W

BRL1, Transcript of Essential nuclear envelope integral membrane protein, yeast

Gene BRL1, Length 1,416 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BRL1	YHR036W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	NRG2	P38082	220 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	YER085C	P40058	173 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	POG1	P40473	351 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	VMA21	P41806	77 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	TAD2	P47058	250 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	UBP8	P50102	471 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	TIM21	P53220	239 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	CAX4	P53223	239 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	UPS3	Q04006	179 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		4.23	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	QCR2	P07257	368 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	HAP3	P13434	144 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	YPS1	P32329	569 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	YKR045C	P36138	183 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	MIC12	P38341	106 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	SWM2	P40342	146 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	YGR219W	P53307	113 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	CYT2	Q00873	224 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	COA6	Q3E846	104 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.22	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.21	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	UGX2	P32772	223 aa		4.21	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	PHD1	P36093	366 aa		4.21	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	COX12	Q01519	83 aa		4.21	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.21	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.21	□□□□□ -1.73
BRL1	YHR036W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	UPS2	P35200	230 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	BOR1	P53838	576 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	CNL1	Q06333	122 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	IRC23	Q08416	157 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.21	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	VPS63	O13549	108 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	HPA3	P39979	161 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	YIL060W	P40519	144 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	GPI15	P53961	229 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	YML018C	Q03730	393 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	ANT1	Q06497	328 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.2	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	SEC22	P22214	214 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	LST8	P41318	303 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	YCH1	P42937	148 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	OST3	P48439	350 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	VHT1	P53241	593 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	PRR2	Q12310	699 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	UBA3	Q99344	299 aa		4.19	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	SAL1	D6W196	494 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	CHO1	P08456	276 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	GAT4	P40569	121 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	YIP3	P53633	176 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	ELC1	Q03071	99 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.18	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	DAD2	P36162	133 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	DER1	P38307	211 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	SIM1	P40472	476 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	HAL1	Q01766	294 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	DPP1	Q05521	289 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	NAT5	Q08689	176 aa		4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	TIR1	P10863	254 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	MRP17	P28778	131 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	POP8	P38208	133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	DOG2	P38773	246 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	DOG1	P38774	246 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	MST28	P39552	234 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	POR2	P40478	281 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	TDA4	P47153	279 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	MST27	P53176	234 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	VBA1	Q04301	562 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	SDH7	Q04401	133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.16	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	YCR023C	P25351	611 aa		4.15	□□□□□ -1.74
BRL1	YHR036W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74

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