RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
SYF2	YGR129W	RTC6	O14464	93 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	PPQ1	P32945	549 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	YJL028W	P47062	111 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	DSK2	P48510	373 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	MIC27	P50945	234 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	TMA23	Q03525	211 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	PHO92	Q06390	306 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	COA2	Q3E823	68 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	AQY1	P0CD91	305 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	YNR071C	P53757	342 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	BOR1	P53838	576 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	SHH3	Q04487	196 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	RDI1	Q12434	202 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	YLR302C	O13544	120 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	VAR1	P02381	398 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	PET100	P38958	111 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	MBB1	P39534	108 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	SAS2	P40963	338 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	YDL183C	P48569	320 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	YMR253C	Q04835	414 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	Q0255	P03881	472 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	SUA5	P32579	426 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	NPL6	P32832	435 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	RRT13	P40042	185 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	SWM2	P40342	146 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	SER2	P42941	309 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	ARR3	Q06598	404 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	COQ3	P27680	312 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	AGA1	P32323	725 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	YGR269W	P40326	108 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	NKP1	Q12493	238 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	RRT15	Q3E811	62 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	SLM6	P38343	150 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	SPI1	P40092	148 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	PUT1	P09368	476 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	KRE9	P39005	276 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	YCH1	P42937	148 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	GPI15	P53961	229 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SYF2	YGR129W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	CPT1	P17898	393 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YPC1	P38298	316 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	SVP26	P38869	228 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	TPN1	P53099	579 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	GPG1	P53130	126 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	DPP1	Q05521	289 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	CTR3	Q06686	241 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YLR042C	Q07990	161 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	ARG80	P07249	177 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	GCN3	P14741	305 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	IES5	P40060	125 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YNL217W	P40152	326 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YDR366C	P87287	132 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	PRR2	Q12310	699 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	IES3	Q12345	250 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	MRPL28	P36527	147 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	DER1	P38307	211 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YGR017W	P53210	297 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YMR082C	Q04276	118 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	RRT7	Q07829	113 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YEA6	P39953	335 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	EMC5	P40540	141 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	KEG1	P43614	200 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	BRP1	P53194	125 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	LCL1	Q02786	101 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	MRX11	Q03079	207 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	FIT2	Q08906	153 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	ATX2	Q12067	313 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	HTB2	P02294	131 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	SPS2	P08459	502 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	SPT14	P32363	452 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YBL059W	P34224	193 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	MGA1	P53050	456 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YMR007W	Q03675	126 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YDR115W	Q04598	105 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SYF2	YGR129W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 95.6 ms